159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1899 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  100 
 
 
561 aa  1158    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.23 
 
 
625 aa  543  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  37.75 
 
 
554 aa  343  4e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  37.55 
 
 
557 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.92 
 
 
525 aa  291  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  38.16 
 
 
540 aa  290  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.48 
 
 
516 aa  279  9e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.4 
 
 
543 aa  266  7e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.89 
 
 
533 aa  252  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.12 
 
 
566 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.29 
 
 
533 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.14 
 
 
565 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.23 
 
 
549 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.5 
 
 
560 aa  231  4e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.66 
 
 
559 aa  227  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  30.61 
 
 
661 aa  223  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  29.7 
 
 
571 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.93 
 
 
560 aa  219  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  31.87 
 
 
598 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.85 
 
 
560 aa  216  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.96 
 
 
599 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.46 
 
 
560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.18 
 
 
563 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  31.26 
 
 
546 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.26 
 
 
546 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.03 
 
 
540 aa  209  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.82 
 
 
547 aa  209  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  28.74 
 
 
563 aa  205  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  34.44 
 
 
546 aa  204  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.26 
 
 
560 aa  203  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.84 
 
 
544 aa  203  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.7 
 
 
535 aa  203  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1328  hypothetical protein  28.91 
 
 
539 aa  200  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.68 
 
 
637 aa  200  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.32 
 
 
540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.02 
 
 
549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.68 
 
 
636 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  31.25 
 
 
572 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  29.12 
 
 
811 aa  196  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  30.98 
 
 
656 aa  196  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.9 
 
 
668 aa  196  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  27.16 
 
 
523 aa  195  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2331  hypothetical protein  33.76 
 
 
519 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  29.83 
 
 
631 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.66 
 
 
526 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  28.99 
 
 
718 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.01 
 
 
629 aa  191  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  28.18 
 
 
536 aa  190  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.77 
 
 
775 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.58 
 
 
534 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  28.03 
 
 
614 aa  187  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.72 
 
 
624 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.88 
 
 
724 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  29.38 
 
 
563 aa  184  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.68 
 
 
716 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.4 
 
 
670 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  29.3 
 
 
537 aa  177  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.51 
 
 
662 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.38 
 
 
549 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.29 
 
 
456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.1 
 
 
571 aa  175  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.385253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.73 
 
 
531 aa  173  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  33.43 
 
 
419 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.15 
 
 
595 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  25.64 
 
 
558 aa  171  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.4 
 
 
433 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.62 
 
 
602 aa  167  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.15 
 
 
556 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2805  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.56 
 
 
674 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75853  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.52 
 
 
730 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6864  hypothetical protein  27.13 
 
 
702 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337654  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  31.01 
 
 
530 aa  166  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  26.43 
 
 
568 aa  166  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.94 
 
 
648 aa  166  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.38 
 
 
447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.68 
 
 
654 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.47 
 
 
500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.66 
 
 
590 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.61 
 
 
646 aa  163  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.71 
 
 
586 aa  163  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.06 
 
 
443 aa  163  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.93 
 
 
478 aa  163  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.15 
 
 
434 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0270124  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1377  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.15 
 
 
434 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.309518  decreased coverage  0.00000579578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  31.49 
 
 
410 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.78 
 
 
433 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.79 
 
 
506 aa  160  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.96 
 
 
553 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.775034 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  31.13 
 
 
446 aa  158  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.42 
 
 
433 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.15 
 
 
426 aa  158  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.97 
 
 
432 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  31.13 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.83 
 
 
426 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1371  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.8 
 
 
434 aa  156  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.01 
 
 
521 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.36 
 
 
672 aa  153  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.01 
 
 
521 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0671  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.6 
 
 
471 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.09 
 
 
521 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>