166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0041 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 506 aa  996    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.85 
 
 		 565 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.6 
 
 		 559 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.23 
 
 		 563 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.34 
 
 		 549 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.22 
 
 		 560 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  31.1 
 
 		 558 aa  243  5e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.42 
 
 		 560 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.86 
 
 		 560 aa  242  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.22 
 
 		 560 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  29.94 
 
 		 563 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  29.74 
 
 		 563 aa  236  7e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  30.33 
 
 		 546 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.82 
 
 		 560 aa  233  7.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  28.97 
 
 		 571 aa  229  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.36 
 
 		 566 aa  224  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.47 
 
 		 547 aa  219  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  29.58 
 
 		 568 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  28.28 
 
 		 536 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  29.45 
 
 		 537 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.38 
 
 		 556 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  26.49 
 
 		 598 aa  209  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  27.53 
 
 		 530 aa  209  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.19 
 
 		 625 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  28.19 
 
 		 554 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  27.61 
 
 		 661 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.16 
 
 		 549 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.62 
 
 		 636 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  26.04 
 
 		 572 aa  200  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  26.04 
 
 		 656 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  29.25 
 
 		 631 aa  197  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.64 
 
 		 629 aa  196  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.27 
 
 		 526 aa  195  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.1 
 
 		 637 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  34.34 
 
 		 563 aa  192  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  31.41 
 
 		 606 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.63 
 
 		 668 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.01 
 
 		 540 aa  189  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  36.59 
 
 		 615 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.59 
 
 		 615 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  36.59 
 
 		 615 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  36.24 
 
 		 616 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  36.59 
 
 		 611 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  36.24 
 
 		 615 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  36.59 
 
 		 615 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  36.59 
 
 		 615 aa  188  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  36.59 
 
 		 615 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  36.59 
 
 		 615 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  36.59 
 
 		 615 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  36.24 
 
 		 615 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.96 
 
 		 535 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  36.24 
 
 		 615 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.75 
 
 		 646 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  35.89 
 
 		 607 aa  186  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.55 
 
 		 648 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.92 
 
 		 672 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.2 
 
 		 531 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.64 
 
 		 624 aa  184  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  31.34 
 
 		 576 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1889  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.99 
 
 		 558 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.362103 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  30.73 
 
 		 575 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  29.22 
 
 		 564 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.82 
 
 		 662 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  26.57 
 
 		 614 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2146  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.54 
 
 		 558 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  25.39 
 
 		 546 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.43 
 
 		 473 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.39 
 
 		 546 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1831  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.24 
 
 		 542 aa  179  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.91 
 
 		 549 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  27.65 
 
 		 557 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1328  hypothetical protein  29.07 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.55 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  34.09 
 
 		 530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 716 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.27 
 
 		 724 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.02 
 
 		 540 aa  173  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.03 
 
 		 599 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  28.64 
 
 		 540 aa  173  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.02 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  32.06 
 
 		 524 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.38 
 
 		 544 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.84 
 
 		 543 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.31 
 
 		 399 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  30.24 
 
 		 502 aa  171  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  30.81 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.81 
 
 		 525 aa  170  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.02 
 
 		 521 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  26.87 
 
 		 718 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.93 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.49 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  32.19 
 
 		 618 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  32.19 
 
 		 596 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  32.19 
 
 		 618 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.33 
 
 		 775 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  32.41 
 
 		 613 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  32.76 
 
 		 513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.81 
 
 		 521 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.65 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>