160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1328 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1328  hypothetical protein  100 
 
 
539 aa  1105    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  48.36 
 
 
523 aa  498  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2331  hypothetical protein  47.47 
 
 
519 aa  491  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.61 
 
 
540 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.43 
 
 
549 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.72 
 
 
534 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.26 
 
 
547 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  30.61 
 
 
554 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  27.37 
 
 
598 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.26 
 
 
625 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  35.81 
 
 
540 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.82 
 
 
540 aa  213  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.38 
 
 
525 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.09 
 
 
566 aa  210  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  31.56 
 
 
557 aa  210  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.71 
 
 
565 aa  209  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.14 
 
 
559 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  31.36 
 
 
568 aa  207  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  28.68 
 
 
561 aa  206  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.72 
 
 
563 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  27.92 
 
 
546 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  31.58 
 
 
563 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.97 
 
 
560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.17 
 
 
533 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.44 
 
 
560 aa  192  9e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  35.49 
 
 
661 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.44 
 
 
531 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.89 
 
 
533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  28.16 
 
 
558 aa  189  8e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.63 
 
 
549 aa  189  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.12 
 
 
516 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  29.62 
 
 
631 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.86 
 
 
636 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.71 
 
 
543 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.27 
 
 
637 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.42 
 
 
648 aa  183  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.67 
 
 
399 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.69 
 
 
646 aa  181  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  28.44 
 
 
536 aa  180  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.52 
 
 
668 aa  179  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  35.35 
 
 
572 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  35.35 
 
 
656 aa  179  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.44 
 
 
500 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2805  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.71 
 
 
674 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75853  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.48 
 
 
662 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.73 
 
 
599 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.7 
 
 
456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.02 
 
 
629 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.79 
 
 
432 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.07 
 
 
560 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.78 
 
 
560 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.48 
 
 
624 aa  173  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  26.51 
 
 
571 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  30.23 
 
 
718 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  27.79 
 
 
614 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.94 
 
 
670 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.62 
 
 
560 aa  169  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2786  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.64 
 
 
587 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.16 
 
 
654 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  25.55 
 
 
546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  29.51 
 
 
563 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.55 
 
 
546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.76 
 
 
526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1371  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.74 
 
 
434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.37 
 
 
506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.63 
 
 
716 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.45 
 
 
434 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0270124  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1377  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.45 
 
 
434 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.309518  decreased coverage  0.00000579578 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  29.59 
 
 
564 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.79 
 
 
426 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.65 
 
 
556 aa  163  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  30.7 
 
 
410 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.5 
 
 
426 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.01 
 
 
672 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  32.87 
 
 
575 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.47 
 
 
544 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  25.8 
 
 
563 aa  161  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  26.69 
 
 
483 aa  161  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  29.07 
 
 
576 aa  160  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  28.12 
 
 
419 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.34 
 
 
535 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.24 
 
 
443 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1327  hypothetical protein  33.33 
 
 
512 aa  158  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.592833  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  27.92 
 
 
811 aa  157  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.95 
 
 
433 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.94 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1861  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.89 
 
 
539 aa  155  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1615  cell wall degradation protein  33.23 
 
 
513 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.12409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.88 
 
 
458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  26.18 
 
 
446 aa  153  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.65 
 
 
447 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.64 
 
 
433 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.51 
 
 
724 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.14 
 
 
595 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  30.17 
 
 
410 aa  150  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  25.92 
 
 
433 aa  150  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.23 
 
 
615 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  31.23 
 
 
611 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  31.23 
 
 
615 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  31.23 
 
 
615 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>