162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0815 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  73.15 
 
 		 433 aa  669    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 443 aa  911    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  74.77 
 
 		 433 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  70.8 
 
 		 410 aa  610  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  67.06 
 
 		 433 aa  585  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  67.06 
 
 		 446 aa  584  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  67.3 
 
 		 433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  63.22 
 
 		 419 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.62 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.51 
 
 		 456 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.42 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.27 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.15 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1371  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.56 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.27 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0270124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1377  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.27 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.309518  decreased coverage  0.00000579578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4673  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.63 
 
 		 540 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.6 
 
 		 545 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.2 
 
 		 399 aa  303  6.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.51 
 
 		 602 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.23 
 
 		 586 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.23 
 
 		 590 aa  293  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.84 
 
 		 595 aa  292  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  38.78 
 
 		 563 aa  246  8e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.34 
 
 		 559 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  39.2 
 
 		 546 aa  242  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.14 
 
 		 566 aa  236  8e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.44 
 
 		 560 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.33 
 
 		 563 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.03 
 
 		 565 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.9 
 
 		 560 aa  233  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.95 
 
 		 549 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  33.01 
 
 		 598 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.47 
 
 		 547 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  35.14 
 
 		 546 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 546 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.53 
 
 		 458 aa  205  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  34.22 
 
 		 502 aa  203  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  34.65 
 
 		 615 aa  202  7e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.88 
 
 		 560 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  36.18 
 
 		 564 aa  202  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.49 
 
 		 540 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.81 
 
 		 544 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  33.68 
 
 		 607 aa  201  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  34.51 
 
 		 606 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  37.25 
 
 		 615 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  34.38 
 
 		 615 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.38 
 
 		 615 aa  200  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  34.38 
 
 		 615 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  34.38 
 
 		 611 aa  200  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  34.38 
 
 		 615 aa  200  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  34.38 
 
 		 615 aa  200  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  37.25 
 
 		 615 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  34.38 
 
 		 615 aa  200  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  34.38 
 
 		 615 aa  200  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  38.99 
 
 		 596 aa  199  6e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 		 599 aa  199  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  36.2 
 
 		 616 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 560 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.86 
 
 		 526 aa  199  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  38.99 
 
 		 618 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  37.46 
 
 		 615 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  38.99 
 
 		 618 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  31.18 
 
 		 571 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.23 
 
 		 484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  35.78 
 
 		 563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  34.1 
 
 		 536 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.08 
 
 		 549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.29 
 
 		 549 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  36.67 
 
 		 575 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  38.08 
 
 		 576 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.14 
 
 		 636 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 472 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.47 
 
 		 521 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 521 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  37.59 
 
 		 613 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.73 
 
 		 521 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.61 
 
 		 560 aa  193  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1889  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.81 
 
 		 558 aa  193  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.362103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.63 
 
 		 625 aa  193  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2146  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.06 
 
 		 558 aa  193  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.44 
 
 		 637 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  34.94 
 
 		 537 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  35.05 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  34.02 
 
 		 530 aa  191  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.99 
 
 		 473 aa  190  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1831  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.79 
 
 		 542 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.86 
 
 		 461 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  31.2 
 
 		 540 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.54 
 
 		 525 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315438  normal  0.0441683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2331  hypothetical protein  28.81 
 
 		 519 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 540 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1223  hypothetical protein  36.66 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41715  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  31.23 
 
 		 557 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  34.24 
 
 		 661 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  30.5 
 
 		 568 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.2 
 
 		 556 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2451  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.16 
 
 		 465 aa  180  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000544854  normal  0.511504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  30.79 
 
 		 523 aa  180  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>