168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1371 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1371  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 434 aa  889    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  94.7 
 
 		 434 aa  827    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0270124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1377  peptidoglycan binding domain-containing protein  94.7 
 
 		 434 aa  827    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.309518  decreased coverage  0.00000579578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  80.41 
 
 		 432 aa  717    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  70.83 
 
 		 426 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  71.66 
 
 		 426 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  60.96 
 
 		 456 aa  528  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.47 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.56 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  50.71 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  50.71 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.13 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.89 
 
 		 433 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  50.85 
 
 		 419 aa  364  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 		 433 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  46.51 
 
 		 410 aa  359  6e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4673  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.13 
 
 		 540 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.26 
 
 		 545 aa  316  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.66 
 
 		 602 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.94 
 
 		 590 aa  306  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.94 
 
 		 586 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.41 
 
 		 595 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 399 aa  295  8e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  34.67 
 
 		 546 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.61 
 
 		 559 aa  219  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.74 
 
 		 563 aa  219  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.73 
 
 		 549 aa  210  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  35.12 
 
 		 563 aa  207  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.49 
 
 		 560 aa  207  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.43 
 
 		 547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 560 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.09 
 
 		 526 aa  196  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  31.85 
 
 		 598 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  34.88 
 
 		 546 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.88 
 
 		 546 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  33.92 
 
 		 563 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  33.14 
 
 		 564 aa  188  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.48 
 
 		 566 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.13 
 
 		 500 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.73 
 
 		 544 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.02 
 
 		 565 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2331  hypothetical protein  29.18 
 
 		 519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  30.99 
 
 		 530 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.26 
 
 		 549 aa  180  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  29.97 
 
 		 523 aa  179  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.95 
 
 		 521 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.92 
 
 		 458 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.5 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  32.36 
 
 		 557 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.66 
 
 		 521 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  34.95 
 
 		 618 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  34.95 
 
 		 618 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.64 
 
 		 540 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  34.95 
 
 		 596 aa  176  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.36 
 
 		 521 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.24 
 
 		 599 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  32.63 
 
 		 536 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  30.73 
 
 		 615 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  33.02 
 
 		 576 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 556 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.07 
 
 		 525 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315438  normal  0.0441683 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  30.73 
 
 		 615 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  30.73 
 
 		 615 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  34.14 
 
 		 615 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  34.14 
 
 		 615 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  34.26 
 
 		 615 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  33.92 
 
 		 615 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.92 
 
 		 615 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  34.26 
 
 		 606 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  34.28 
 
 		 616 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  33.92 
 
 		 611 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  33.92 
 
 		 615 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  33.92 
 
 		 615 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  33.92 
 
 		 615 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  31.99 
 
 		 537 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  30.59 
 
 		 607 aa  170  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.69 
 
 		 472 aa  169  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  34.49 
 
 		 613 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  30.34 
 
 		 563 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1501  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.74 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  28.02 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.52 
 
 		 549 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.91 
 
 		 560 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  29.78 
 
 		 554 aa  167  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  32.66 
 
 		 513 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  28.77 
 
 		 571 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  29.25 
 
 		 575 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 530 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  31.19 
 
 		 568 aa  166  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1328  hypothetical protein  28.74 
 
 		 539 aa  166  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 560 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2451  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000544854  normal  0.511504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.19 
 
 		 451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 540 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.08 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.12 
 
 		 553 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.775034 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  30.03 
 
 		 540 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.48 
 
 		 625 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.06 
 
 		 560 aa  159  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>