159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3106 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  95.77 
 
 		 426 aa  793    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 426 aa  872    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  68.41 
 
 		 432 aa  593  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1371  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  68.55 
 
 		 434 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  67.32 
 
 		 434 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0270124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1377  peptidoglycan binding domain-containing protein  67.32 
 
 		 434 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.309518  decreased coverage  0.00000579578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  64.89 
 
 		 447 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  65.99 
 
 		 456 aa  537  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.55 
 
 		 443 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  51.34 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.7 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  51.89 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  51.34 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.21 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.23 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  49.46 
 
 		 410 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4673  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.99 
 
 		 540 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.86 
 
 		 545 aa  319  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.15 
 
 		 590 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.04 
 
 		 602 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.88 
 
 		 586 aa  302  9e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.97 
 
 		 399 aa  292  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  37.11 
 
 		 546 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.54 
 
 		 559 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.61 
 
 		 563 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.43 
 
 		 547 aa  211  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  35 
 
 		 563 aa  206  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.02 
 
 		 560 aa  204  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.93 
 
 		 549 aa  194  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.71 
 
 		 526 aa  193  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.14 
 
 		 560 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  33.33 
 
 		 598 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.2 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.86 
 
 		 560 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.55 
 
 		 560 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  34.23 
 
 		 546 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.23 
 
 		 546 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.6 
 
 		 566 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  31.36 
 
 		 571 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.83 
 
 		 544 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.45 
 
 		 540 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.9 
 
 		 556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.96 
 
 		 565 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.86 
 
 		 560 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 458 aa  179  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  33.84 
 
 		 536 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2331  hypothetical protein  28.08 
 
 		 519 aa  176  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  33.33 
 
 		 564 aa  176  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.07 
 
 		 540 aa  172  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  32.06 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.95 
 
 		 599 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  30.65 
 
 		 563 aa  170  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  32.28 
 
 		 568 aa  170  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  30.56 
 
 		 523 aa  170  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.86 
 
 		 534 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  36.45 
 
 		 530 aa  169  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  29.54 
 
 		 530 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.98 
 
 		 461 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  35.53 
 
 		 513 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.42 
 
 		 472 aa  166  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.3 
 
 		 549 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  30.32 
 
 		 557 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1328  hypothetical protein  30.79 
 
 		 539 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2451  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.45 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000544854  normal  0.511504 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.12 
 
 		 484 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  33.04 
 
 		 483 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  35.34 
 
 		 614 aa  163  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  35.07 
 
 		 576 aa  162  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.4 
 
 		 668 aa  162  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.39 
 
 		 615 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  32.23 
 
 		 615 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  36.39 
 
 		 615 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  36.39 
 
 		 611 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  36.39 
 
 		 615 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.31 
 
 		 636 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  36.39 
 
 		 615 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  36.39 
 
 		 615 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  36.39 
 
 		 615 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  36.39 
 
 		 615 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.1 
 
 		 521 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  31.83 
 
 		 575 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.6 
 
 		 521 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.91 
 
 		 637 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.91 
 
 		 525 aa  160  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  32.37 
 
 		 524 aa  160  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1501  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 498 aa  159  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  34.26 
 
 		 631 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  32.15 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.3 
 
 		 521 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.03 
 
 		 506 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1615  cell wall degradation protein  30.43 
 
 		 513 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.12409 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  31.72 
 
 		 656 aa  158  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  32.42 
 
 		 572 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  29.15 
 
 		 540 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.4 
 
 		 624 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.27 
 
 		 533 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.57 
 
 		 625 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  32.76 
 
 		 613 aa  157  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  34.18 
 
 		 661 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>