159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1781 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
500 aa  1001    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.54 
 
 
566 aa  246  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.62 
 
 
549 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.42 
 
 
559 aa  238  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.57 
 
 
563 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.12 
 
 
565 aa  233  6e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.23 
 
 
547 aa  230  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  31.18 
 
 
571 aa  226  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  33.33 
 
 
546 aa  223  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.17 
 
 
560 aa  219  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.79 
 
 
560 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.75 
 
 
556 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.02 
 
 
560 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.11 
 
 
560 aa  213  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  32.1 
 
 
563 aa  212  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.9 
 
 
560 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.79 
 
 
549 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.42 
 
 
549 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.29 
 
 
540 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.55 
 
 
629 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.68 
 
 
599 aa  204  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  33.63 
 
 
554 aa  203  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  33.73 
 
 
540 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  32.14 
 
 
530 aa  200  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.1 
 
 
625 aa  200  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.46 
 
 
526 aa  197  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  32.75 
 
 
546 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.75 
 
 
546 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.54 
 
 
540 aa  196  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.54 
 
 
624 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  31.23 
 
 
523 aa  194  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  31.34 
 
 
558 aa  192  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  32.51 
 
 
598 aa  190  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.93 
 
 
426 aa  190  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.5 
 
 
399 aa  190  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  29.55 
 
 
563 aa  190  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  31.56 
 
 
536 aa  189  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.98 
 
 
433 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.03 
 
 
426 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  34.22 
 
 
433 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.13 
 
 
434 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0270124  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1377  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.13 
 
 
434 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.309518  decreased coverage  0.00000579578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1371  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.13 
 
 
434 aa  187  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.53 
 
 
432 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.17 
 
 
716 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  34.22 
 
 
446 aa  186  9e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  32.89 
 
 
419 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  28.7 
 
 
568 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.4 
 
 
544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  31.67 
 
 
557 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.97 
 
 
525 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  32.05 
 
 
811 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  31.3 
 
 
718 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.62 
 
 
433 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.97 
 
 
672 aa  180  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.88 
 
 
506 aa  179  8e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1328  hypothetical protein  33.04 
 
 
539 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.53 
 
 
433 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.79 
 
 
534 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.96 
 
 
531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.36 
 
 
775 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.58 
 
 
724 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.73 
 
 
730 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.32 
 
 
447 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  31.49 
 
 
410 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  31.17 
 
 
615 aa  170  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  31.17 
 
 
615 aa  170  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.13 
 
 
543 aa  170  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  31.17 
 
 
615 aa  170  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  31.17 
 
 
615 aa  170  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.17 
 
 
615 aa  170  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.6 
 
 
535 aa  170  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.68 
 
 
516 aa  169  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  31.17 
 
 
615 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  31.17 
 
 
615 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  29.57 
 
 
661 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6864  hypothetical protein  30.79 
 
 
702 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337654  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.55 
 
 
443 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  33.16 
 
 
615 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  31.61 
 
 
537 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  35.34 
 
 
611 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.17 
 
 
456 aa  167  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.17 
 
 
648 aa  167  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.91 
 
 
668 aa  167  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  29.92 
 
 
606 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  29.74 
 
 
561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  28.95 
 
 
483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  34.62 
 
 
615 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  29.98 
 
 
615 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  34.62 
 
 
615 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.94 
 
 
646 aa  163  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.94 
 
 
662 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  29.31 
 
 
616 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2786  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.4 
 
 
587 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  32.09 
 
 
607 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  28.39 
 
 
656 aa  162  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  33.11 
 
 
618 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  33.11 
 
 
596 aa  162  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  33.11 
 
 
618 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4673  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.52 
 
 
540 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>