164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_06430 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
547 aa  1107    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.38 
 
 
559 aa  353  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  33.47 
 
 
563 aa  312  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.14 
 
 
560 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.41 
 
 
549 aa  293  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.62 
 
 
563 aa  293  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  31.16 
 
 
598 aa  293  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.84 
 
 
565 aa  291  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.07 
 
 
560 aa  273  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.32 
 
 
566 aa  273  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.26 
 
 
549 aa  272  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  31.24 
 
 
546 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.24 
 
 
546 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.2 
 
 
560 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.88 
 
 
560 aa  266  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  34.1 
 
 
564 aa  266  8.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  31.86 
 
 
563 aa  262  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.52 
 
 
544 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  31.64 
 
 
571 aa  257  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.4 
 
 
599 aa  257  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  32.68 
 
 
568 aa  256  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.84 
 
 
540 aa  256  8e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  32 
 
 
554 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.82 
 
 
625 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  29.82 
 
 
563 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.37 
 
 
540 aa  253  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  31.28 
 
 
576 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.22 
 
 
556 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  32.73 
 
 
558 aa  250  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.48 
 
 
560 aa  249  8e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  30.41 
 
 
546 aa  249  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.3 
 
 
534 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  31.15 
 
 
575 aa  246  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.19 
 
 
531 aa  239  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1328  hypothetical protein  30.26 
 
 
539 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.16 
 
 
399 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  28.68 
 
 
607 aa  236  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  29.46 
 
 
718 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.46 
 
 
724 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1327  hypothetical protein  35.11 
 
 
512 aa  232  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.592833  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.9 
 
 
535 aa  232  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.33 
 
 
716 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.57 
 
 
629 aa  231  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.84 
 
 
549 aa  230  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  27.12 
 
 
536 aa  230  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  28.71 
 
 
606 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  30 
 
 
500 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  35.49 
 
 
540 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  38.18 
 
 
410 aa  229  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  30.27 
 
 
523 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.04 
 
 
624 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  37.5 
 
 
618 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  37.5 
 
 
596 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  37.5 
 
 
618 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  31.9 
 
 
557 aa  228  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  28.21 
 
 
615 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.46 
 
 
456 aa  226  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  28.21 
 
 
615 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  27.83 
 
 
615 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.83 
 
 
668 aa  226  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  33.33 
 
 
524 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  27.78 
 
 
616 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  36.21 
 
 
613 aa  224  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  29.81 
 
 
661 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.02 
 
 
543 aa  223  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  29.62 
 
 
537 aa  223  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  32.66 
 
 
419 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  34.74 
 
 
410 aa  222  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2331  hypothetical protein  35.14 
 
 
519 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  27.2 
 
 
615 aa  221  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  27.39 
 
 
611 aa  221  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  27.39 
 
 
615 aa  220  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.39 
 
 
615 aa  220  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  27.39 
 
 
615 aa  220  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  27.39 
 
 
615 aa  220  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  27.39 
 
 
615 aa  220  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  27.39 
 
 
615 aa  220  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  27.39 
 
 
615 aa  220  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1615  cell wall degradation protein  37.62 
 
 
513 aa  219  7.999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.12409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  28.28 
 
 
530 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.65 
 
 
648 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  27.83 
 
 
572 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  27.83 
 
 
656 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.65 
 
 
646 aa  217  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.39 
 
 
458 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  29.88 
 
 
811 aa  216  9e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.12 
 
 
662 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.54 
 
 
672 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.67 
 
 
433 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.57 
 
 
433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.33 
 
 
730 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.42 
 
 
553 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.775034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.83 
 
 
516 aa  214  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.87 
 
 
636 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.61 
 
 
526 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  29.63 
 
 
446 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.06 
 
 
533 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.43 
 
 
533 aa  213  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.47 
 
 
443 aa  213  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  29.63 
 
 
433 aa  213  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>