161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1767 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
526 aa  1073    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.2 
 
 
563 aa  294  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.13 
 
 
560 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  33.13 
 
 
563 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.47 
 
 
560 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.69 
 
 
549 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.99 
 
 
565 aa  269  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  30.99 
 
 
530 aa  260  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.25 
 
 
566 aa  250  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  30.06 
 
 
558 aa  249  7e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  29.79 
 
 
546 aa  249  8e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  31.33 
 
 
568 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  29.23 
 
 
563 aa  243  5e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.36 
 
 
549 aa  242  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.55 
 
 
559 aa  240  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  30.02 
 
 
571 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.91 
 
 
560 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.05 
 
 
560 aa  230  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  28.23 
 
 
537 aa  226  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.35 
 
 
560 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  29.8 
 
 
598 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  29.12 
 
 
554 aa  219  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  29 
 
 
525 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.67 
 
 
549 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.61 
 
 
547 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.78 
 
 
521 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  28.54 
 
 
540 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.28 
 
 
625 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.78 
 
 
521 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  27.03 
 
 
546 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.03 
 
 
546 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.51 
 
 
521 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.81 
 
 
516 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.76 
 
 
599 aa  206  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.4 
 
 
525 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315438  normal  0.0441683 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.99 
 
 
484 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  33.54 
 
 
419 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.7 
 
 
451 aa  204  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  35.03 
 
 
410 aa  203  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4673  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.16 
 
 
540 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.63 
 
 
447 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  28.01 
 
 
557 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.68 
 
 
672 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.77 
 
 
571 aa  200  7e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.385253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.61 
 
 
533 aa  200  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.86 
 
 
443 aa  200  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.87 
 
 
456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.65 
 
 
545 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.39 
 
 
590 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.39 
 
 
586 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  27.31 
 
 
661 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2146  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.12 
 
 
558 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.08 
 
 
602 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.46 
 
 
500 aa  197  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.95 
 
 
458 aa  196  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  29.27 
 
 
523 aa  196  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1889  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.49 
 
 
558 aa  196  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.362103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1371  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.09 
 
 
434 aa  196  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.09 
 
 
434 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0270124  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1377  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.09 
 
 
434 aa  195  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.309518  decreased coverage  0.00000579578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1831  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.81 
 
 
542 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.23 
 
 
533 aa  194  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.64 
 
 
595 aa  193  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.02 
 
 
426 aa  193  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.77 
 
 
544 aa  193  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.33 
 
 
556 aa  193  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.86 
 
 
668 aa  193  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.29 
 
 
433 aa  192  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  27.66 
 
 
811 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.71 
 
 
426 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  36.46 
 
 
502 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.85 
 
 
716 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  28.66 
 
 
561 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.57 
 
 
654 aa  192  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.48 
 
 
540 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.48 
 
 
553 aa  191  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.775034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.83 
 
 
636 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.06 
 
 
506 aa  190  7e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.92 
 
 
432 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.06 
 
 
433 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  37.2 
 
 
513 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2451  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.23 
 
 
465 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000544854  normal  0.511504 
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  27.7 
 
 
572 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  36.9 
 
 
618 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.38 
 
 
433 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  36.9 
 
 
596 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  36.9 
 
 
618 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  34.35 
 
 
563 aa  187  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  27.81 
 
 
656 aa  187  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  26.67 
 
 
631 aa  187  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  37.1 
 
 
615 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.26 
 
 
670 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  36.46 
 
 
530 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  27.21 
 
 
606 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  36.08 
 
 
613 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  27.52 
 
 
536 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  36.75 
 
 
615 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.03 
 
 
637 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  31.43 
 
 
564 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  36.75 
 
 
616 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>