161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3942 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  100 
 
 
557 aa  1129    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  71.69 
 
 
540 aa  771    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  60.97 
 
 
525 aa  598  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  61.54 
 
 
516 aa  593  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.47 
 
 
543 aa  550  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.03 
 
 
533 aa  500  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.03 
 
 
533 aa  501  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.8 
 
 
625 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  42.69 
 
 
554 aa  352  8e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  37.55 
 
 
561 aa  309  9e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.97 
 
 
565 aa  280  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.66 
 
 
566 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  35.5 
 
 
598 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.38 
 
 
559 aa  262  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.04 
 
 
563 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.35 
 
 
549 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  33.74 
 
 
558 aa  251  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  32.64 
 
 
563 aa  246  8e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.8 
 
 
560 aa  246  9e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.52 
 
 
599 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  31.03 
 
 
568 aa  245  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.37 
 
 
560 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.71 
 
 
549 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  30.98 
 
 
571 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.26 
 
 
560 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.86 
 
 
560 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  34.61 
 
 
546 aa  230  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.74 
 
 
547 aa  229  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.07 
 
 
636 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.4 
 
 
544 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  35.23 
 
 
546 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.23 
 
 
546 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.71 
 
 
534 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.86 
 
 
560 aa  223  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  31.8 
 
 
563 aa  221  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  31.15 
 
 
661 aa  220  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  31.8 
 
 
614 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.67 
 
 
540 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.63 
 
 
637 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.18 
 
 
556 aa  217  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.66 
 
 
672 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  33.06 
 
 
536 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  32.31 
 
 
523 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.82 
 
 
629 aa  210  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1328  hypothetical protein  31.56 
 
 
539 aa  210  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  32.58 
 
 
530 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  32.29 
 
 
537 aa  206  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  34.36 
 
 
606 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  39.93 
 
 
611 aa  204  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  39.93 
 
 
615 aa  204  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.93 
 
 
615 aa  204  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  39.93 
 
 
615 aa  203  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  39.93 
 
 
615 aa  204  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  39.93 
 
 
615 aa  203  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  39.93 
 
 
615 aa  204  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  39.93 
 
 
615 aa  204  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  39.93 
 
 
615 aa  204  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.37 
 
 
531 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.46 
 
 
526 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  33.77 
 
 
615 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  33.77 
 
 
615 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  33.19 
 
 
615 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.54 
 
 
535 aa  200  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2331  hypothetical protein  31.52 
 
 
519 aa  199  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.25 
 
 
540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  33.12 
 
 
616 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.96 
 
 
399 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.65 
 
 
624 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  29.71 
 
 
631 aa  197  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.49 
 
 
549 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34 
 
 
670 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  32.38 
 
 
483 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.54 
 
 
654 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.26 
 
 
648 aa  194  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1861  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.51 
 
 
539 aa  193  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.99 
 
 
662 aa  193  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2805  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.02 
 
 
674 aa  193  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75853  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  38.98 
 
 
575 aa  192  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  30.47 
 
 
656 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.86 
 
 
646 aa  190  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  30.6 
 
 
572 aa  189  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  33.71 
 
 
607 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  38.49 
 
 
613 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  33.43 
 
 
419 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.71 
 
 
433 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.5 
 
 
668 aa  188  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  29.64 
 
 
811 aa  186  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.05 
 
 
443 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  38.41 
 
 
576 aa  186  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.39 
 
 
716 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.03 
 
 
602 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  37.88 
 
 
563 aa  184  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.67 
 
 
500 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.5 
 
 
434 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0270124  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1377  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.5 
 
 
434 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.309518  decreased coverage  0.00000579578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.52 
 
 
775 aa  183  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  36.3 
 
 
564 aa  183  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  30.39 
 
 
433 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  30.39 
 
 
446 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.14 
 
 
484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>