161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6864 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  64.07 
 
 		 811 aa  836    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  69.16 
 
 		 718 aa  932    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 730 aa  930    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  68.12 
 
 		 724 aa  919    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  70.71 
 
 		 716 aa  959    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  60.73 
 
 		 775 aa  881    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6864  hypothetical protein  100 
 
 		 702 aa  1419    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337654  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.52 
 
 		 672 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.41 
 
 		 629 aa  324  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.47 
 
 		 670 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 624 aa  305  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.93 
 
 		 654 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.85 
 
 		 648 aa  295  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.24 
 
 		 646 aa  290  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.6 
 
 		 662 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2805  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 674 aa  260  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.69 
 
 		 566 aa  242  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.02 
 
 		 559 aa  240  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.83 
 
 		 565 aa  240  8e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  33.79 
 
 		 536 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.79 
 
 		 540 aa  233  9e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  31.25 
 
 		 563 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.16 
 
 		 547 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  30.27 
 
 		 661 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.86 
 
 		 625 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.51 
 
 		 549 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.85 
 
 		 560 aa  218  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  32.74 
 
 		 546 aa  217  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.74 
 
 		 546 aa  217  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.68 
 
 		 544 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.22 
 
 		 668 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.66 
 
 		 636 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  32.42 
 
 		 530 aa  213  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  32.3 
 
 		 598 aa  213  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.74 
 
 		 637 aa  211  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.94 
 
 		 549 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  31.57 
 
 		 614 aa  208  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  30.54 
 
 		 656 aa  207  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  30.41 
 
 		 563 aa  205  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  30.82 
 
 		 572 aa  203  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.41 
 
 		 560 aa  203  8e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  29.1 
 
 		 546 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.59 
 
 		 563 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  31.06 
 
 		 631 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.94 
 
 		 540 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.67 
 
 		 556 aa  198  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  31 
 
 		 537 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.65 
 
 		 534 aa  193  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.17 
 
 		 571 aa  192  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.385253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.16 
 
 		 531 aa  191  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  27.99 
 
 		 568 aa  191  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  28.85 
 
 		 554 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.59 
 
 		 599 aa  188  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  29.9 
 
 		 557 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  27.65 
 
 		 558 aa  183  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  31.72 
 
 		 540 aa  181  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.52 
 
 		 549 aa  181  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 560 aa  180  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  28.63 
 
 		 523 aa  180  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 560 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 516 aa  179  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0427  hypothetical protein  37.7 
 
 		 499 aa  177  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.198884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.15 
 
 		 526 aa  177  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.38 
 
 		 560 aa  176  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  27.13 
 
 		 561 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.74 
 
 		 500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.74 
 
 		 543 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  29.13 
 
 		 571 aa  170  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2331  hypothetical protein  27.35 
 
 		 519 aa  170  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  32.67 
 
 		 563 aa  167  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.82 
 
 		 525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.6 
 
 		 533 aa  165  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  34.94 
 
 		 483 aa  165  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 607 aa  164  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  33.45 
 
 		 615 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 399 aa  161  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  33.45 
 
 		 615 aa  161  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  33.45 
 
 		 606 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  33.45 
 
 		 616 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  33.45 
 
 		 615 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.6 
 
 		 533 aa  160  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  34.65 
 
 		 575 aa  159  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  32.45 
 
 		 564 aa  159  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  33.99 
 
 		 576 aa  159  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.7 
 
 		 506 aa  157  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  32.42 
 
 		 615 aa  154  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  32.42 
 
 		 615 aa  154  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  32.42 
 
 		 615 aa  154  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  32.42 
 
 		 611 aa  154  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  32.42 
 
 		 615 aa  154  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  32.42 
 
 		 615 aa  154  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  32.42 
 
 		 615 aa  154  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  32.42 
 
 		 615 aa  154  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.42 
 
 		 615 aa  154  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.53 
 
 		 553 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.775034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.87 
 
 		 602 aa  153  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  32.01 
 
 		 613 aa  153  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4673  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.27 
 
 		 540 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.6 
 
 		 595 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>