161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0427 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0427  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  1011    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.198884  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1440  hypothetical protein  47.8 
 
 		 409 aa  323  5e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0895828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1361  hypothetical protein  40.61 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.841061  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.13 
 
 		 730 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  40.34 
 
 		 718 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6864  hypothetical protein  37.74 
 
 		 702 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337654  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.28 
 
 		 670 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.83 
 
 		 724 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.08 
 
 		 654 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 716 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.65 
 
 		 775 aa  171  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  37.71 
 
 		 811 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.01 
 
 		 629 aa  162  9e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.44 
 
 		 672 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2805  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.91 
 
 		 674 aa  160  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 624 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.45 
 
 		 648 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.14 
 
 		 646 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.98 
 
 		 662 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0671  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.48 
 
 		 471 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.51 
 
 		 637 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.68 
 
 		 636 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  34.73 
 
 		 614 aa  143  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  31.64 
 
 		 563 aa  143  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.65 
 
 		 668 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.09 
 
 		 535 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.85 
 
 		 547 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 560 aa  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  32.57 
 
 		 656 aa  141  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  32.57 
 
 		 572 aa  140  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  38.08 
 
 		 523 aa  139  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.47 
 
 		 559 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  33.61 
 
 		 558 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2331  hypothetical protein  35.71 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  34.4 
 
 		 631 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.03 
 
 		 571 aa  134  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.385253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.22 
 
 		 549 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  33.6 
 
 		 568 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.88 
 
 		 565 aa  130  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  33.73 
 
 		 661 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  33.2 
 
 		 564 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  33.47 
 
 		 615 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.17 
 
 		 526 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.3 
 
 		 566 aa  127  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  34.38 
 
 		 563 aa  126  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  35.32 
 
 		 576 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 556 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.55 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.55 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  33.06 
 
 		 615 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  33.06 
 
 		 615 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  30.15 
 
 		 571 aa  125  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  33.06 
 
 		 606 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.12 
 
 		 549 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  33.06 
 
 		 616 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 607 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.02 
 
 		 563 aa  124  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.16 
 
 		 560 aa  123  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  32.8 
 
 		 615 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.8 
 
 		 615 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  32.8 
 
 		 611 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  32.8 
 
 		 615 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  32.8 
 
 		 615 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  32.8 
 
 		 615 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  32.8 
 
 		 615 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  32.8 
 
 		 615 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  32.8 
 
 		 615 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  31.17 
 
 		 546 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  35.71 
 
 		 575 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 546 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  29.88 
 
 		 410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  32.17 
 
 		 530 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.2 
 
 		 549 aa  121  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.24 
 
 		 560 aa  120  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.04 
 
 		 625 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  31.52 
 
 		 536 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.74 
 
 		 540 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  32.1 
 
 		 557 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.05 
 
 		 506 aa  117  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.74 
 
 		 599 aa  117  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  33.33 
 
 		 618 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  33.33 
 
 		 596 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  33.33 
 
 		 618 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.25 
 
 		 458 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  32.02 
 
 		 613 aa  116  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  30.89 
 
 		 563 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  29.01 
 
 		 546 aa  115  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.54 
 
 		 540 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.46 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  31.4 
 
 		 483 aa  113  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  31.05 
 
 		 540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 553 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.775034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.2 
 
 		 531 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1861  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.14 
 
 		 539 aa  110  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1223  hypothetical protein  29.37 
 
 		 318 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41715  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1328  hypothetical protein  31.88 
 
 		 539 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.94 
 
 		 461 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0490  hypothetical protein  27.78 
 
 		 572 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>