165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2008 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2008  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 434 aa  892    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  38.44 
 
 		 483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  33.33 
 
 		 598 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.38 
 
 		 559 aa  180  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.7 
 
 		 544 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  32.53 
 
 		 618 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  32.53 
 
 		 618 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  32.53 
 
 		 596 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  36.24 
 
 		 410 aa  169  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  32.68 
 
 		 502 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.99 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  30.75 
 
 		 576 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.7 
 
 		 560 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 521 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  30.47 
 
 		 536 aa  167  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.57 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  29.88 
 
 		 546 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  31.93 
 
 		 563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.14 
 
 		 521 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.48 
 
 		 521 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  31.87 
 
 		 563 aa  163  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  31.69 
 
 		 563 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.66 
 
 		 525 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315438  normal  0.0441683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  29.16 
 
 		 575 aa  160  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  31.56 
 
 		 564 aa  160  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.12 
 
 		 484 aa  159  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  31.78 
 
 		 524 aa  159  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.49 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  31.43 
 
 		 613 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.96 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  31.15 
 
 		 546 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 546 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  30.96 
 
 		 615 aa  156  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.96 
 
 		 615 aa  156  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  30.96 
 
 		 615 aa  156  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  30.96 
 
 		 615 aa  156  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  30.96 
 
 		 615 aa  156  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  30.96 
 
 		 615 aa  156  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  30.96 
 
 		 611 aa  156  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  30.96 
 
 		 615 aa  156  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  30.96 
 
 		 615 aa  156  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  31.58 
 
 		 557 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.45 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  31.46 
 
 		 530 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.9 
 
 		 775 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  31.18 
 
 		 606 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  31.18 
 
 		 615 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.94 
 
 		 458 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2451  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 465 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000544854  normal  0.511504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.46 
 
 		 426 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.54 
 
 		 549 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  31.18 
 
 		 615 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2146  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.49 
 
 		 558 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.89 
 
 		 556 aa  153  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 525 aa  152  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1371  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.45 
 
 		 434 aa  152  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.46 
 
 		 426 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1889  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.85 
 
 		 558 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.362103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  30.6 
 
 		 616 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  29.33 
 
 		 607 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  30.82 
 
 		 615 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.74 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0270124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1377  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.74 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.309518  decreased coverage  0.00000579578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.29 
 
 		 560 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.29 
 
 		 560 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1831  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.01 
 
 		 542 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 443 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1501  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 498 aa  150  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  32.61 
 
 		 513 aa  150  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1327  hypothetical protein  31.89 
 
 		 512 aa  149  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.592833  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  31.62 
 
 		 568 aa  149  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.61 
 
 		 549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.59 
 
 		 560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.89 
 
 		 590 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.51 
 
 		 586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.16 
 
 		 540 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.83 
 
 		 602 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  34.03 
 
 		 571 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  29.62 
 
 		 540 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1615  cell wall degradation protein  31.13 
 
 		 513 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.12409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  32.1 
 
 		 554 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  29.51 
 
 		 811 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  27.16 
 
 		 419 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  31.14 
 
 		 558 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.51 
 
 		 724 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.76 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.14 
 
 		 533 aa  144  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.79 
 
 		 534 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.59 
 
 		 433 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.06 
 
 		 473 aa  142  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  29.5 
 
 		 410 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.59 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.37 
 
 		 730 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.69 
 
 		 560 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.76 
 
 		 571 aa  140  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.385253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.51 
 
 		 716 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.11 
 
 		 563 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  30 
 
 		 535 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.1 
 
 		 461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.17 
 
 		 565 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>