84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4100 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4100  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  354  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141571  normal  0.294645 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 294 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  35.11 
 
 		 294 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  35.11 
 
 		 294 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  35.11 
 
 		 294 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  32.43 
 
 		 305 aa  52  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  51.6  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.88 
 
 		 141 aa  51.2  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  32.37 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  37.86 
 
 		 313 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 295 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  32.39 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 		 289 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  33.08 
 
 		 275 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 289 aa  48.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  26.09 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  29.1 
 
 		 138 aa  47.4  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  31.3 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1902  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156681  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  33.54 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.28 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  33.82 
 
 		 294 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  24.53 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  26.42 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.06 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 137 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  33.33 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  33.33 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  30.41 
 
 		 317 aa  45.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 277 aa  45.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 137 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  32.14 
 
 		 281 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  29.55 
 
 		 271 aa  44.7  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 294 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  30.83 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  28.76 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  32.09 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  37.84 
 
 		 321 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  27.89 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 297 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  33.08 
 
 		 296 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.58 
 
 		 288 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 		 324 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  30.92 
 
 		 295 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  36.3 
 
 		 274 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 294 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  30.07 
 
 		 288 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2069  UspA domain protein  30.94 
 
 		 288 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000374133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35 
 
 		 288 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  30.66 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  31.72 
 
 		 295 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  30.82 
 
 		 295 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  30.22 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  31.29 
 
 		 294 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  24.26 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  31.51 
 
 		 308 aa  42.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 294 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1798  UspA domain protein  36.79 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104152  normal  0.0257832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  33.09 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  34.82 
 
 		 298 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  28.89 
 
 		 143 aa  42  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 297 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  34.29 
 
 		 297 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  28.24 
 
 		 143 aa  42.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  30.37 
 
 		 295 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  30.37 
 
 		 295 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  30.37 
 
 		 295 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  28.68 
 
 		 290 aa  41.2  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  28.28 
 
 		 147 aa  41.6  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.29 
 
 		 284 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  35.78 
 
 		 159 aa  41.6  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 288 aa  41.6  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  29.5 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  34.29 
 
 		 302 aa  41.2  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  30.56 
 
 		 144 aa  40.8  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 137 aa  40.8  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 449 aa  40.8  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>