57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1790 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  665    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  60.06 
 
 
310 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  61.25 
 
 
290 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  53.29 
 
 
343 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  52.31 
 
 
319 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  57.97 
 
 
293 aa  298  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  49.83 
 
 
318 aa  289  6e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  42.27 
 
 
341 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  40.65 
 
 
321 aa  222  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  37.92 
 
 
351 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  40.94 
 
 
327 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  36.86 
 
 
361 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  40.28 
 
 
328 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  40.21 
 
 
321 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  33.99 
 
 
372 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  34.98 
 
 
383 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  33.54 
 
 
349 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  31.89 
 
 
365 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  30.75 
 
 
349 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  34.74 
 
 
363 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  32.92 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  27.03 
 
 
364 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  28.34 
 
 
371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  35.9 
 
 
341 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  36.02 
 
 
220 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  29.77 
 
 
318 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  27.96 
 
 
352 aa  99.8  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  29.37 
 
 
354 aa  92.4  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  27.93 
 
 
307 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  30.03 
 
 
352 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  28.84 
 
 
390 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  29.41 
 
 
361 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  29.1 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  32.55 
 
 
365 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  23.39 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  28.51 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  30.83 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  27.78 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  28.1 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  30 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  28.14 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  27.05 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  27.67 
 
 
393 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  29.5 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  27.71 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  25.15 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  26.24 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  27.42 
 
 
408 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.08 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  36.94 
 
 
520 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  38.46 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  26.49 
 
 
402 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  31.93 
 
 
506 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  39.08 
 
 
518 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2447  hypothetical protein  27.03 
 
 
259 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.300506 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  31.46 
 
 
322 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  31.46 
 
 
323 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>