50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2411 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  99.68 
 
 
316 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  832    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  47.86 
 
 
393 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  37.33 
 
 
411 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  37.97 
 
 
402 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.14 
 
 
413 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.713533 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1494  hypothetical protein  98.15 
 
 
54 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  28.53 
 
 
363 aa  103  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  29.73 
 
 
364 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  33.2 
 
 
359 aa  84  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  31.43 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  31.49 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  34.08 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  26.41 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  28.77 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  26.59 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  31.36 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  31.69 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  31.56 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  31.51 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  28.26 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  27.17 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  28.73 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  28.11 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  26.98 
 
 
318 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  32.43 
 
 
321 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  30.32 
 
 
372 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  25.68 
 
 
307 aa  63.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  30.33 
 
 
365 aa  63.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  30.39 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  31.35 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  38.36 
 
 
392 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  40.32 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  28.21 
 
 
341 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  34.19 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  29.75 
 
 
220 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  38.36 
 
 
299 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  24.53 
 
 
371 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  28.19 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  34.83 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  26.67 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  33 
 
 
356 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  35.8 
 
 
390 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  30.77 
 
 
297 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  32.43 
 
 
518 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  34.15 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  37.97 
 
 
506 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  32.22 
 
 
365 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.87 
 
 
321 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  32.88 
 
 
520 aa  42.7  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>