51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2897 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  733    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  66.39 
 
 
365 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  54.6 
 
 
354 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  50 
 
 
352 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  46.13 
 
 
369 aa  312  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  43.68 
 
 
371 aa  268  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  41.55 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  63.81 
 
 
520 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  39.43 
 
 
390 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  52.58 
 
 
506 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  43.08 
 
 
392 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  44.14 
 
 
368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  47.55 
 
 
518 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  30.77 
 
 
318 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  32.05 
 
 
321 aa  89.7  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  29.92 
 
 
310 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  29.23 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  28.48 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  33.91 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  29.83 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  28.69 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  29.5 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  27.73 
 
 
290 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  29.27 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  29.29 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  30.24 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  30.71 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  27.78 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  32.02 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  28.39 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  29.5 
 
 
293 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  31.14 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  28.45 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  31.63 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  29.35 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  39.58 
 
 
299 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  29.18 
 
 
365 aa  63.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  26.69 
 
 
356 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  27.52 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  25.46 
 
 
341 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  30.2 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  42.86 
 
 
411 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  27.37 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  34.83 
 
 
408 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  35.71 
 
 
316 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  27.4 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  27.91 
 
 
349 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  27.4 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  26.83 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1693  RND family efflux transporter MFP subunit  30.89 
 
 
421 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000207824  decreased coverage  0.00534917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  39.19 
 
 
318 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>