56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28020 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  598  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  61.25 
 
 
321 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  60.55 
 
 
310 aa  359  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  56.38 
 
 
319 aa  322  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  51.83 
 
 
343 aa  299  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  57.61 
 
 
293 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  52.84 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  43.36 
 
 
341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  43.57 
 
 
328 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  40.13 
 
 
321 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  41.43 
 
 
361 aa  202  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  40.42 
 
 
351 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  40.34 
 
 
321 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  39.43 
 
 
327 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  39.4 
 
 
349 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  42.6 
 
 
372 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  36.84 
 
 
383 aa  169  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  33.54 
 
 
365 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  36.15 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  37.09 
 
 
363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  31.91 
 
 
341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  35.02 
 
 
392 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  34.03 
 
 
349 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  30.03 
 
 
371 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  34.26 
 
 
220 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  28.38 
 
 
318 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  31.33 
 
 
352 aa  99  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  33.07 
 
 
365 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  30.9 
 
 
352 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  28.57 
 
 
368 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  31.54 
 
 
369 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  28.85 
 
 
307 aa  89  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  30.34 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  32.23 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  34.07 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  29.41 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  27.9 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  32.18 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  30 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  26.69 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  28.71 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  29.82 
 
 
299 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  26.46 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  30.19 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  25.11 
 
 
408 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  27.02 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  25.67 
 
 
338 aa  63.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  30.43 
 
 
316 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  36.11 
 
 
520 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  26.88 
 
 
402 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  30.71 
 
 
518 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  33.72 
 
 
506 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.73 
 
 
321 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2447  hypothetical protein  29.63 
 
 
259 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.300506 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  34.72 
 
 
322 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>