40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3164 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  100 
 
 
520 aa  1057    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  85.33 
 
 
365 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  41.95 
 
 
506 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  38.01 
 
 
518 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  63.81 
 
 
361 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  53.14 
 
 
352 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  51.27 
 
 
354 aa  190  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  45.41 
 
 
369 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  43.18 
 
 
407 aa  157  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  37.96 
 
 
390 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  56.34 
 
 
371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  38.14 
 
 
368 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  33.33 
 
 
392 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  29.39 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  33.77 
 
 
319 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  33.61 
 
 
299 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  31.48 
 
 
310 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  30.37 
 
 
321 aa  62  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  29.12 
 
 
349 aa  62  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  35.4 
 
 
364 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  31.48 
 
 
307 aa  60.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  29.35 
 
 
328 aa  60.1  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  39.81 
 
 
343 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  36.94 
 
 
321 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  36.11 
 
 
290 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  27.04 
 
 
321 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  32 
 
 
363 aa  57.4  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  27.56 
 
 
341 aa  57  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  24.75 
 
 
351 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  28.57 
 
 
327 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  25.41 
 
 
361 aa  54.7  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  31.5 
 
 
293 aa  54.3  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  24.64 
 
 
372 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  28.12 
 
 
341 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  31.36 
 
 
220 aa  50.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  24.06 
 
 
383 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  32.65 
 
 
411 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  27.64 
 
 
365 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  28.85 
 
 
393 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  32.88 
 
 
316 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>