47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7465 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  69.28 
 
 
352 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  48.94 
 
 
365 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  46.99 
 
 
361 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  44.86 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  37.66 
 
 
390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  36.62 
 
 
371 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  37.33 
 
 
407 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  49.42 
 
 
520 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  37.98 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  33.84 
 
 
368 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  41.09 
 
 
506 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  41.82 
 
 
518 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  29.9 
 
 
318 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  28 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  29.8 
 
 
310 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  31.54 
 
 
290 aa  89.7  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  29.77 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  31.98 
 
 
343 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  32.28 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  32.03 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  29.35 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  30.83 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  31.17 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  30.18 
 
 
328 aa  77  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  28.33 
 
 
364 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  25.81 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  29.92 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  29.25 
 
 
220 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  25.1 
 
 
363 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  28.02 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  27.71 
 
 
383 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  29.06 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  27.31 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  27.66 
 
 
341 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  27.54 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  37.36 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  22.29 
 
 
307 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  28 
 
 
351 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  25.81 
 
 
318 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  30.86 
 
 
411 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  28.12 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  34.15 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  39.39 
 
 
316 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  26.48 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  26.67 
 
 
362 aa  43.5  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  25.93 
 
 
359 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>