48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3160 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  744    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  66.67 
 
 
361 aa  463  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  85.33 
 
 
520 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  50 
 
 
352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  50.58 
 
 
354 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  46.43 
 
 
369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  43.65 
 
 
371 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  37.85 
 
 
390 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  39.95 
 
 
407 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  51.61 
 
 
506 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  35.13 
 
 
392 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  38.65 
 
 
368 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  47.4 
 
 
518 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  29.25 
 
 
318 aa  97.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  27.46 
 
 
321 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  29.19 
 
 
349 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  26.58 
 
 
319 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  33.61 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  31.05 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  27.8 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  30.52 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  26.69 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  30.18 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  27.82 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  32.08 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  27.76 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  27.71 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  28.38 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  28.57 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  36.96 
 
 
299 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  25.31 
 
 
361 aa  60.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  23.74 
 
 
351 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  24.31 
 
 
372 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  26.74 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  25.58 
 
 
220 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  23.5 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  23.97 
 
 
383 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  27.06 
 
 
352 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  24.43 
 
 
349 aa  49.7  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  26.23 
 
 
297 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  27.94 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  28.77 
 
 
362 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  22.22 
 
 
356 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  32.65 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  30.41 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  32.22 
 
 
408 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  28.72 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>