58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2011 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  591  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  59.42 
 
 		 321 aa  324  9e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  58.97 
 
 		 319 aa  322  6e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  56.55 
 
 		 290 aa  317  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  56.6 
 
 		 343 aa  298  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  56.02 
 
 		 310 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  54.34 
 
 		 318 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  43.38 
 
 		 321 aa  222  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  43.94 
 
 		 341 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  44.96 
 
 		 327 aa  208  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  43.42 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  45.8 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  39.94 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  40.51 
 
 		 351 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  38.85 
 
 		 361 aa  175  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  40.73 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  35.39 
 
 		 349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  32.6 
 
 		 365 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  35.16 
 
 		 364 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  35.12 
 
 		 392 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  34.42 
 
 		 363 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  31.71 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  31.4 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  28.83 
 
 		 371 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  30.4 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  34.3 
 
 		 220 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  29.92 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  31.03 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  31.19 
 
 		 352 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  30.45 
 
 		 318 aa  99.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  30.83 
 
 		 354 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  29.14 
 
 		 369 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  26.88 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  30.25 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  29.86 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  31.98 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  32.75 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  28.27 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  31.79 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  30.17 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  29.95 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  29.17 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  26.05 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  26.77 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  27.44 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  28.38 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  30.39 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  27.23 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  31.68 
 
 		 518 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  34.78 
 
 		 506 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  27.23 
 
 		 402 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  28.06 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2447  hypothetical protein  27.39 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300506 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  27.56 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  27.56 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4509  extracellular metalloprotease  31.25 
 
 		 175 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000972631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>