55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1963 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  694    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  53.95 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  51.83 
 
 
290 aa  310  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  50 
 
 
310 aa  302  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  50 
 
 
319 aa  293  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  56.21 
 
 
293 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  43.44 
 
 
318 aa  265  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  44.86 
 
 
321 aa  222  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  42.11 
 
 
341 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  38.23 
 
 
351 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  40.99 
 
 
327 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  42.63 
 
 
328 aa  204  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  44.52 
 
 
321 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  36.09 
 
 
361 aa  192  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  38.03 
 
 
383 aa  182  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  35.95 
 
 
372 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  37.46 
 
 
349 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  33.77 
 
 
365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  36.15 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  36.82 
 
 
392 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  31.89 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  32.99 
 
 
349 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  30.24 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  36.84 
 
 
220 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  28.86 
 
 
354 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  30.25 
 
 
352 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  26.22 
 
 
371 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  30.33 
 
 
390 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  30.06 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  31.9 
 
 
365 aa  92.8  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  27.78 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  31.98 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  24.53 
 
 
307 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  33.06 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  28.99 
 
 
362 aa  84  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  28.87 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  32.54 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  31.05 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  30.24 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  30.81 
 
 
393 aa  79.3  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  27.7 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  29.32 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  29.22 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  33.33 
 
 
520 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  31.35 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  28.95 
 
 
301 aa  60.1  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  28.8 
 
 
408 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  30.57 
 
 
338 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  26.42 
 
 
402 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  26.79 
 
 
411 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  30.3 
 
 
518 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  27.47 
 
 
506 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  32.35 
 
 
316 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.82 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2447  hypothetical protein  30.89 
 
 
259 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.300506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>