48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8296 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  100 
 
 
506 aa  1021    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  45.22 
 
 
518 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  41.53 
 
 
520 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  64.98 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  45.17 
 
 
390 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  52.28 
 
 
361 aa  203  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  50.7 
 
 
365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  43.19 
 
 
407 aa  176  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  48.88 
 
 
352 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  53.96 
 
 
371 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  41.09 
 
 
369 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  42.42 
 
 
392 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  52.08 
 
 
368 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  34.15 
 
 
349 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  37.7 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  34.45 
 
 
299 aa  64.3  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  35.64 
 
 
318 aa  63.9  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  31.58 
 
 
307 aa  63.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  39 
 
 
327 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  27.8 
 
 
321 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  33.15 
 
 
328 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  38.95 
 
 
364 aa  61.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  34.38 
 
 
319 aa  60.1  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  37.61 
 
 
393 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  38.71 
 
 
363 aa  57.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  36.96 
 
 
321 aa  57  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  32.61 
 
 
361 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  34.41 
 
 
351 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  35.29 
 
 
220 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  28.45 
 
 
356 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  31.93 
 
 
321 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  31.52 
 
 
372 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  34.09 
 
 
310 aa  53.5  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  34.78 
 
 
293 aa  53.5  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  35.87 
 
 
343 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  32.26 
 
 
362 aa  51.6  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  26.09 
 
 
383 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  33.72 
 
 
290 aa  50.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  32.26 
 
 
359 aa  50.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  38 
 
 
411 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  29.44 
 
 
297 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  38.1 
 
 
402 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  31.94 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  26.61 
 
 
365 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  36.46 
 
 
318 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  37.97 
 
 
408 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  37.97 
 
 
316 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>