51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2400 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  39.69 
 
 
365 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  29.59 
 
 
351 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  31.1 
 
 
318 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  33.1 
 
 
341 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  29.58 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  33.57 
 
 
321 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  28.34 
 
 
321 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  29.77 
 
 
321 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  29.68 
 
 
293 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  28.62 
 
 
372 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  28.71 
 
 
290 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  30.61 
 
 
327 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  28.28 
 
 
319 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  28.81 
 
 
349 aa  96.7  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  31.4 
 
 
383 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  27.48 
 
 
328 aa  92.4  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  30.6 
 
 
343 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  25.6 
 
 
361 aa  89.7  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  27.16 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  27.7 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  29.15 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  32.57 
 
 
364 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  27.96 
 
 
392 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  26.07 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  29 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  29.27 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  34.59 
 
 
220 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  28.57 
 
 
363 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  27.47 
 
 
354 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  26.96 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  30.15 
 
 
299 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  27.07 
 
 
365 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  28.87 
 
 
393 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  29.35 
 
 
359 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  29.08 
 
 
411 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  25.81 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  28.86 
 
 
362 aa  53.5  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  27.35 
 
 
361 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2887  hypothetical protein  39.42 
 
 
260 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  25.62 
 
 
352 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  28.44 
 
 
338 aa  49.7  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  22.32 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  32.64 
 
 
506 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2447  hypothetical protein  28.21 
 
 
259 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.300506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  30.48 
 
 
402 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  32.84 
 
 
407 aa  46.2  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  23.97 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  26.54 
 
 
311 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  32.65 
 
 
390 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  29.67 
 
 
365 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>