55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0105 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  663    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  70.34 
 
 
328 aa  421  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  57.27 
 
 
321 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  41.97 
 
 
341 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  42.91 
 
 
321 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  42.4 
 
 
293 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  39.72 
 
 
321 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  37.69 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  39.43 
 
 
290 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  39.42 
 
 
343 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  37.55 
 
 
318 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  38.35 
 
 
372 aa  179  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  38.83 
 
 
319 aa  168  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  34.86 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  35.48 
 
 
361 aa  159  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  35.4 
 
 
383 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  35.22 
 
 
349 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  28.46 
 
 
364 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  29.07 
 
 
363 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  31.86 
 
 
341 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  31.46 
 
 
365 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  28.05 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  30.29 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  30.79 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  33.33 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  29.71 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  31.36 
 
 
368 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  30.6 
 
 
318 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  34.63 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  30.66 
 
 
220 aa  89  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  29.77 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  27.47 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  28.65 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  28.15 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  30.29 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  29.73 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  25.95 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  29.44 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  30.81 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  25.08 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  27.76 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  28.29 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.03 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  29.65 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  29.19 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  29.22 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  30.74 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  30.29 
 
 
402 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  39 
 
 
506 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  46.38 
 
 
316 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  25.27 
 
 
407 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  28.57 
 
 
520 aa  56.2  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2447  hypothetical protein  27.62 
 
 
259 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.300506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  31.67 
 
 
518 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  23.73 
 
 
301 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>