55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3153 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  754    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  67.86 
 
 		 363 aa  514  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  28.46 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  36.28 
 
 		 318 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  37.56 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  36.15 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  36.15 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  35.65 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  36.11 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  33.18 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  30.23 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  33.02 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  28.22 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  35.98 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  35.16 
 
 		 293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  32.13 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  33.92 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  34.42 
 
 		 383 aa  102  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  26.04 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  31.09 
 
 		 354 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  31.22 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  28.82 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  26.98 
 
 		 365 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  29.5 
 
 		 408 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  31.73 
 
 		 371 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  32.83 
 
 		 362 aa  87  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  32.28 
 
 		 359 aa  85.9  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  30.43 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  29.63 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  33.61 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  31.61 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  29.55 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  30.34 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  29.27 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  28.62 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  28.33 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  36.61 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  25 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  27.35 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  25.6 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  25.95 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  31.65 
 
 		 318 aa  67  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  38.95 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  35.4 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  28.57 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  29.82 
 
 		 518 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.12 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  32.29 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  28.34 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.81 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.713533 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  28.89 
 
 		 322 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  29.37 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5027  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.82 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  25.76 
 
 		 356 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>