61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3627 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  716    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  51.86 
 
 		 361 aa  309  5e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  54.55 
 
 		 341 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  43.45 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  38.8 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  39.72 
 
 		 310 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  41.84 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  40.42 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  38.71 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  42.66 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  38.95 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  39.93 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  38.6 
 
 		 293 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  36.01 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  34.86 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  34.29 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  30.6 
 
 		 365 aa  142  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  34.2 
 
 		 349 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  33.53 
 
 		 352 aa  126  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  30.56 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  35.55 
 
 		 392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  33.84 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  29.52 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  26.04 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  29.78 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  30.99 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  33.94 
 
 		 220 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  25.98 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  26.64 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  28.24 
 
 		 307 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  29.96 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  32.02 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  31.46 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  29.62 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  27.78 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  28.48 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  27.24 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  26.79 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  28.45 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  34.22 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  36.45 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  26.62 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  25.67 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  32.57 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  27.17 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  25.93 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  32.38 
 
 		 316 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  23.74 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  29.85 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  34.41 
 
 		 506 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  24.75 
 
 		 520 aa  56.2  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  28 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.09 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  32.93 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4522  extracellular metalloprotease  29.46 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0902848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  28.21 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  28.21 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1110  S2 family protease  27.27 
 
 		 228 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5547  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.28 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  28.97 
 
 		 368 aa  43.5  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  28.7 
 
 		 368 aa  43.5  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>