55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0375 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  40.55 
 
 
349 aa  138  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  35.65 
 
 
310 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  34.86 
 
 
321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  38.6 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  36.84 
 
 
343 aa  128  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  35.62 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  37.9 
 
 
318 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  36.45 
 
 
341 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  34.26 
 
 
290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  34.47 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  33.64 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  35.1 
 
 
392 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  33.94 
 
 
351 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  33.64 
 
 
307 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  31.67 
 
 
361 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  35.24 
 
 
383 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  30.92 
 
 
354 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  30.66 
 
 
327 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  34.19 
 
 
365 aa  99.4  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  35.05 
 
 
356 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  32.74 
 
 
328 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  31.5 
 
 
371 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  31.37 
 
 
363 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  30.73 
 
 
372 aa  92  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  32.74 
 
 
321 aa  91.7  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  35.11 
 
 
349 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  30.71 
 
 
361 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  33.68 
 
 
364 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  32.87 
 
 
368 aa  86.3  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  34.34 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  32.89 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  33.13 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  28.36 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  24.91 
 
 
390 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  34.04 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  31.51 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  29.83 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  28.99 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  29.9 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  38.24 
 
 
506 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  25.58 
 
 
365 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  30.72 
 
 
297 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2447  hypothetical protein  38.18 
 
 
259 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.300506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  37.36 
 
 
518 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  31.36 
 
 
520 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  27.75 
 
 
408 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  32.08 
 
 
316 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  26.84 
 
 
402 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  27.59 
 
 
411 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.89 
 
 
321 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  30.43 
 
 
311 aa  45.4  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0527  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.32 
 
 
235 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.265786 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  27.05 
 
 
338 aa  41.6  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>