53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8295 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  719    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  50.26 
 
 
390 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  54.73 
 
 
361 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  49.45 
 
 
365 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  45.33 
 
 
371 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  49.07 
 
 
352 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  64.98 
 
 
506 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  42.9 
 
 
369 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  39.95 
 
 
407 aa  219  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  43.46 
 
 
392 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  53.01 
 
 
520 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  40.16 
 
 
368 aa  185  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  65.22 
 
 
518 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  34.04 
 
 
321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  32.91 
 
 
318 aa  119  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  30.25 
 
 
349 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  29.83 
 
 
341 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  32.51 
 
 
343 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  30.06 
 
 
310 aa  99.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  31.12 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  31.09 
 
 
364 aa  96.7  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  31.06 
 
 
327 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  30.83 
 
 
293 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  30.11 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  26.64 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  34.04 
 
 
372 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  29.83 
 
 
363 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  30.92 
 
 
220 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  32.8 
 
 
365 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  31.75 
 
 
383 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  29.19 
 
 
361 aa  86.3  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  33.51 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  30 
 
 
290 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  32.68 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  30.45 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  25.54 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  30.85 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  36.46 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  25.93 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  27.48 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  25.82 
 
 
352 aa  56.6  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  31.25 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  28.45 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  29.54 
 
 
297 aa  53.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  26.02 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  31.25 
 
 
311 aa  50.4  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  26.64 
 
 
338 aa  50.4  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  26.04 
 
 
362 aa  50.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  29.03 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  42.86 
 
 
316 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  42.86 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  25.25 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  26.24 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>