37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7802 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  742    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  33.2 
 
 
293 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  28.16 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  33.07 
 
 
290 aa  97.1  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  31.58 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  31.98 
 
 
310 aa  89.4  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  33.2 
 
 
319 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  33.09 
 
 
318 aa  86.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  30.12 
 
 
365 aa  86.3  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  33.99 
 
 
328 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  32.42 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  29.62 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  30.57 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  29.62 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  28.52 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  27.46 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  28.29 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  29.84 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  28.51 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  28.21 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  29.34 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  31.44 
 
 
383 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  29.75 
 
 
372 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  29.9 
 
 
220 aa  59.7  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  26.43 
 
 
318 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  28.57 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  27.05 
 
 
392 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  24.73 
 
 
371 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  27.49 
 
 
393 aa  53.1  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  29.47 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  25.09 
 
 
368 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  23.37 
 
 
307 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  26.35 
 
 
354 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  30.77 
 
 
297 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  43.64 
 
 
407 aa  43.1  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  46.55 
 
 
506 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  24.04 
 
 
338 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>