37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0778 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  709    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  93.53 
 
 
311 aa  585  1e-166  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  55.06 
 
 
301 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  27.63 
 
 
351 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  28.67 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  32.4 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  26.99 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  29.47 
 
 
328 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  25.95 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  27.46 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  28.51 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  26.62 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  29 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  30.29 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  25.67 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  25.81 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  24.62 
 
 
310 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  25.46 
 
 
343 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  29.34 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  27.35 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  28.79 
 
 
368 aa  56.2  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  30.83 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  25.27 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  27.47 
 
 
392 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  27.34 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  23.68 
 
 
365 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  28.38 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  23.08 
 
 
371 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  33.71 
 
 
318 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  29.19 
 
 
407 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  25.49 
 
 
390 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  25.65 
 
 
362 aa  46.6  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  26.26 
 
 
359 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  29.37 
 
 
352 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  27.66 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0382  hypothetical protein  48.78 
 
 
121 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.525474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  24.04 
 
 
365 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>