57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0821 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  100 
 
 		 372 aa  738    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  59.6 
 
 		 383 aa  342  9e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  44.48 
 
 		 321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  48 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  40.65 
 
 		 351 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  40.14 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  40.54 
 
 		 318 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  38.35 
 
 		 327 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  37.79 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  45.5 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  42.6 
 
 		 290 aa  173  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  33.99 
 
 		 321 aa  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  35.91 
 
 		 328 aa  172  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  37.5 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  36.63 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  35.62 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  37.58 
 
 		 349 aa  139  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  34.78 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  33.49 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  32.13 
 
 		 364 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  31.77 
 
 		 349 aa  100  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  34.22 
 
 		 352 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  31.23 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  28.71 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  28.96 
 
 		 341 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  28.98 
 
 		 318 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  30.49 
 
 		 356 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  34.04 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  26.4 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  28.57 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  30.73 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  31.47 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  31.14 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  29.47 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  31.12 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  33.33 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  32.51 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  35.96 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  28.02 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  31.02 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  30.26 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  30.48 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  39.73 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  39.73 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  28.5 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  29.44 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  25 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  31.52 
 
 		 506 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  27.72 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  23.74 
 
 		 520 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  35.06 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  26.56 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  30.77 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  25.14 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4509  extracellular metalloprotease  30.43 
 
 		 175 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000972631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>