53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8294 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  797    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  42.21 
 
 
368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  38.21 
 
 
371 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  41.41 
 
 
354 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  43.08 
 
 
361 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  35.14 
 
 
365 aa  189  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  39.07 
 
 
390 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  39.38 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  37.98 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  37.24 
 
 
321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  33.22 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  36.86 
 
 
343 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  30.12 
 
 
318 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  34.15 
 
 
518 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  28.83 
 
 
327 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  29.7 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  32.92 
 
 
321 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  33.47 
 
 
341 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  28.95 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  35.37 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  33.77 
 
 
310 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  30.24 
 
 
349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  35.12 
 
 
293 aa  116  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  35.55 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  34.91 
 
 
372 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  42.42 
 
 
506 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  31.78 
 
 
361 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  33.33 
 
 
520 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  28.98 
 
 
328 aa  106  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  28.49 
 
 
321 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  31.73 
 
 
307 aa  103  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  35.1 
 
 
220 aa  100  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  31.98 
 
 
365 aa  93.6  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  31.43 
 
 
352 aa  93.6  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  26.87 
 
 
363 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  31.25 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  27.18 
 
 
349 aa  87  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  30.43 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  31 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  26.54 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  27.78 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  38.36 
 
 
408 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  38.36 
 
 
316 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  27.69 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  27.98 
 
 
362 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  26.11 
 
 
411 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  26.47 
 
 
393 aa  57  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  27.05 
 
 
365 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  27.23 
 
 
311 aa  52.8  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  27.23 
 
 
338 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  27.1 
 
 
301 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  34.07 
 
 
356 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  26.5 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>