58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1792 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  60.06 
 
 
321 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  60.55 
 
 
290 aa  359  3e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  56.25 
 
 
319 aa  306  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  50.49 
 
 
343 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  47.67 
 
 
318 aa  267  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  53.56 
 
 
293 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  42.2 
 
 
321 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  41.67 
 
 
341 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  39.72 
 
 
351 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  37.65 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  37.69 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  40.34 
 
 
328 aa  195  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  40.43 
 
 
321 aa  189  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  36.22 
 
 
349 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  36.63 
 
 
372 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  32.46 
 
 
383 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  34.53 
 
 
349 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  35.65 
 
 
364 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  28.48 
 
 
365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  36.11 
 
 
363 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  35.65 
 
 
220 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  33.77 
 
 
392 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  31.25 
 
 
341 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  29.18 
 
 
318 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  28.07 
 
 
371 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  29.88 
 
 
352 aa  102  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  27.91 
 
 
368 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  30.03 
 
 
354 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  29.8 
 
 
369 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  27.63 
 
 
390 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  31.98 
 
 
365 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  26.46 
 
 
307 aa  85.9  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  32.35 
 
 
352 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  29.08 
 
 
361 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  31.11 
 
 
359 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  30.45 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  31.31 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  30.56 
 
 
362 aa  79  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  29.94 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  30.97 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  29.51 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  24.53 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  35.06 
 
 
518 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  33.14 
 
 
520 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  26.76 
 
 
408 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  27.75 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  24.42 
 
 
311 aa  59.7  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.25 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  24.62 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  23.51 
 
 
301 aa  55.8  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  34.09 
 
 
506 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  24.55 
 
 
411 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  32.94 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  32.94 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4509  extracellular metalloprotease  25.99 
 
 
175 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000972631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  22.91 
 
 
402 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4522  extracellular metalloprotease  28.12 
 
 
306 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0902848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>