50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4913 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  793    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  49.72 
 
 
354 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  40.12 
 
 
365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  40.54 
 
 
352 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  39.15 
 
 
361 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  39.68 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  37.66 
 
 
369 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  40.91 
 
 
371 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  45.17 
 
 
506 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  39.07 
 
 
392 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  39.21 
 
 
518 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  40.51 
 
 
520 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  32.96 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  32.09 
 
 
318 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  30.71 
 
 
321 aa  96.7  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  30.22 
 
 
343 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  31.7 
 
 
293 aa  96.3  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  26.06 
 
 
349 aa  92.8  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  27.99 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  27.63 
 
 
310 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  30.34 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  28.84 
 
 
321 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  28.02 
 
 
341 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  28.79 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  26.71 
 
 
321 aa  77  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  28.62 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  28.31 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  29.44 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  26.45 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  24.33 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  26.94 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  25.84 
 
 
351 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  24.91 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  27.1 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  25 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  34.55 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  28.17 
 
 
299 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  23.7 
 
 
349 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  27.64 
 
 
352 aa  57  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  22.03 
 
 
307 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  35.48 
 
 
301 aa  53.5  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  26.41 
 
 
359 aa  53.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  25.97 
 
 
362 aa  50.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  26.36 
 
 
356 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  33.87 
 
 
411 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  36.84 
 
 
408 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  30.08 
 
 
338 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  36.84 
 
 
316 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  31.96 
 
 
311 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  32.65 
 
 
318 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>