26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2447 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2447  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.300506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  30.52 
 
 
307 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  32.67 
 
 
299 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  31.47 
 
 
356 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  29.19 
 
 
321 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  25.82 
 
 
368 aa  59.3  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  25.11 
 
 
327 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  25.11 
 
 
328 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  30.89 
 
 
220 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  31.4 
 
 
341 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  27.5 
 
 
293 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  29.79 
 
 
349 aa  52.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  26.32 
 
 
321 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  29.7 
 
 
343 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  26.99 
 
 
361 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  26.77 
 
 
318 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  26.67 
 
 
319 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  27.23 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  33.65 
 
 
383 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  26.24 
 
 
321 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  28.92 
 
 
290 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  23.42 
 
 
349 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.41 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  25.37 
 
 
365 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  25.76 
 
 
369 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  35.29 
 
 
372 aa  42  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>