67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1554 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  45.58 
 
 
233 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  41.55 
 
 
209 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  41.3 
 
 
283 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  35 
 
 
229 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  44.19 
 
 
278 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  38.57 
 
 
263 aa  118  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  32.89 
 
 
258 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 
263 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  40 
 
 
263 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  35.27 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  32.46 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  41.62 
 
 
274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  35.47 
 
 
260 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  36.96 
 
 
267 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 
260 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  34.76 
 
 
279 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  33.5 
 
 
260 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  34.76 
 
 
279 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  33.81 
 
 
276 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  35.35 
 
 
260 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.86 
 
 
259 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  33.17 
 
 
219 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  33.81 
 
 
256 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  35 
 
 
279 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  35.88 
 
 
268 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.38 
 
 
259 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  33.49 
 
 
260 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.5 
 
 
235 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  35.52 
 
 
273 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.96 
 
 
264 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 
260 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 
260 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  38.1 
 
 
260 aa  97.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 
256 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  37.62 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  37.62 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  37.62 
 
 
260 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  37.62 
 
 
260 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  37.62 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.63 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  37.62 
 
 
260 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  32.47 
 
 
261 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  33.94 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  32.31 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.91 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  31.61 
 
 
263 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  32.65 
 
 
259 aa  85.1  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  30.39 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  28.65 
 
 
232 aa  62  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  25.17 
 
 
231 aa  51.6  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2879  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.23 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0817  molybdate transporter periplasmic protein  24.23 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2899  molybdate transporter periplasmic protein  24.23 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00185371  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0866  molybdate transporter periplasmic protein  23.79 
 
 
257 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101767  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0790  molybdate transporter periplasmic protein  23.35 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0786  molybdate transporter periplasmic protein  23.35 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0684  molybdate transporter periplasmic protein  22.91 
 
 
257 aa  45.4  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
335 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2540  hypothetical protein  26.17 
 
 
183 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.560007 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 
335 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 
335 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05725  ABC-type molybdate transport system periplasmic component  22.13 
 
 
250 aa  42.4  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.51 
 
 
335 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1370  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.09 
 
 
262 aa  42  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.215303  normal  0.092476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>