76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0544 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 260 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  89.19 
 
 		 279 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  88.76 
 
 		 279 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  89.88 
 
 		 260 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  93.77 
 
 		 260 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  90 
 
 		 260 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  90.38 
 
 		 260 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  90 
 
 		 260 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  84.62 
 
 		 260 aa  440  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  88.08 
 
 		 260 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  72.37 
 
 		 259 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  76.26 
 
 		 256 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  72.94 
 
 		 276 aa  359  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  71.6 
 
 		 259 aa  359  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  69.26 
 
 		 256 aa  348  7e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  70.77 
 
 		 260 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  70.77 
 
 		 260 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  73.5 
 
 		 260 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  70.38 
 
 		 260 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  70.38 
 
 		 260 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  70.38 
 
 		 260 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  72.65 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  63.42 
 
 		 279 aa  324  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  67.1 
 
 		 259 aa  297  9e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  53.67 
 
 		 268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  51.92 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  58.95 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  58.8 
 
 		 263 aa  261  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  58.52 
 
 		 263 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  53.39 
 
 		 273 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  53.36 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  51.64 
 
 		 274 aa  218  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  51.52 
 
 		 283 aa  218  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  45.77 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  49.34 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  38.15 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  44.2 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  44.2 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  36.52 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  38.59 
 
 		 229 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  39.62 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  38.92 
 
 		 236 aa  125  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.84 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  32.97 
 
 		 219 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.29 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  37.5 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  39.87 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  38.37 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.68 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  24.79 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  30.26 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.66 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2178  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.68 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000275297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0449  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.21 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2236  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  26.25 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607578  normal  0.187927 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3757  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0635929 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3667  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341489  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3228  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3860  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0644367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4504  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0793086  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0809  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.51 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2973  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.53 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3197  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.73 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1283  molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4339  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.05 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0970  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  25.31 
 
 		 272 aa  46.2  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2941  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  28.24 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3543  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.27 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2848  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  25.27 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50670  molybdenum transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.83 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.646558  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0106  putative molybdate-binding periplasmic signal peptide protein  25.45 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0979  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.51 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2756  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  25.94 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0851797  normal  0.0478662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1370  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.7 
 
 		 262 aa  42.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.215303  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3323  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.74 
 
 		 249 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>