61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6046 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  44.31 
 
 		 263 aa  218  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.37 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  42.8 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  43.46 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  41.13 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  41.13 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  39.5 
 
 		 278 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  38.04 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  37.39 
 
 		 283 aa  175  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  37.01 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  38.43 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  37.4 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.05 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  36.22 
 
 		 279 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.45 
 
 		 259 aa  164  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  36.86 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  36.8 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  37.83 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  36.55 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  37.6 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  37.39 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  37.39 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  37.39 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  39.39 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  38.96 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  38.96 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  39.3 
 
 		 260 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  39.3 
 
 		 260 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  39.3 
 
 		 260 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  35.71 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  36.52 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  37.05 
 
 		 233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  36.22 
 
 		 229 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  39.78 
 
 		 235 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  29.63 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  29.22 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  32.5 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.84 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  33.02 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  36.09 
 
 		 230 aa  98.6  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  32.17 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  32.47 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.14 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  31.75 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  31.92 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.69 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  25.74 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0449  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.42 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2941  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  26.1 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2424  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  25.81 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3319  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.53 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0367  molybdenum ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  25.71 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4885  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.72 
 
 		 290 aa  42  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0276  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.62 
 
 		 264 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0123729 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2427  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.24 
 
 		 277 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>