76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_4123 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 258 aa  517  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  99.61 
 
 		 272 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  99.22 
 
 		 258 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  68.3 
 
 		 229 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  58.97 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  56.88 
 
 		 219 aa  252  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  54.91 
 
 		 230 aa  245  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  50.22 
 
 		 235 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  47.58 
 
 		 235 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  49.77 
 
 		 235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  48.89 
 
 		 230 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  47.85 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  40.53 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.3 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  45.66 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  44.39 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  46.77 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  45.35 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  45.35 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  45.35 
 
 		 260 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  44.75 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  44.51 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  45.65 
 
 		 274 aa  151  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  44.2 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  44.86 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  40.11 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  43.93 
 
 		 279 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  40.18 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  36.1 
 
 		 283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  39.66 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  41.4 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  39.04 
 
 		 276 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  41.71 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  41.71 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  41.71 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  41.71 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  41.71 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  38.17 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  40.64 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  41.18 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  38.3 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  37.43 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  42.21 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  37.1 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  37.63 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  36.11 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  37.3 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  32.89 
 
 		 226 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  28.45 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  31.79 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1160  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.09 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000579456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2054  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.55 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2342  molybdate ABC transporter, molybdate-binding protein  22.13 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.237075  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2540  hypothetical protein  31.03 
 
 		 183 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.560007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4941  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.97 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4477  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.97 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.763394 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1443  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.77 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3481  molybdate-binding periplasmic protein precursor  21.79 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01600  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.13 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.658672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0970  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  21.85 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1534  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  20.92 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133844  hitchhiker  0.00863376 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0410  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.75 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00464746  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1453  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.32 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1094  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.95 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3863  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdenum-binding protein  27.75 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1556  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  28.11 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2665  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.94 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0609537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2560  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  22.76 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403904  normal  0.205693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3197  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.7 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1942  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.72 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3444  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.68 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.430967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1558  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  22.36 
 
 		 277 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.455674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0813  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.45 
 
 		 263 aa  42  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>