61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0618 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  34.81 
 
 
229 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.44 
 
 
264 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 
273 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  30.34 
 
 
260 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  28.45 
 
 
258 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  30.34 
 
 
260 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  28.45 
 
 
272 aa  94.4  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 
260 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  29.91 
 
 
260 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  30.04 
 
 
260 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  30.04 
 
 
260 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  30.04 
 
 
260 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
263 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 
260 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 
263 aa  89  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  29.61 
 
 
229 aa  85.5  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 
279 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  29.19 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  29.19 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.42 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.95 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  31.84 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  29.69 
 
 
263 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.11 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.74 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  29.81 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  28.1 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  29.91 
 
 
230 aa  72  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  24.36 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  25.96 
 
 
274 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  30.33 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  25.26 
 
 
256 aa  62.4  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 
263 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
261 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  26.67 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  25.17 
 
 
226 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3545  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.14 
 
 
255 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3481  molybdate-binding periplasmic protein precursor  28.19 
 
 
250 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3427  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  24.56 
 
 
251 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  26.62 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1211  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.63 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000848846 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1493  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein, putative  23.63 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0367  molybdenum ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  23.08 
 
 
270 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40390  molybdate-binding periplasmic protein precursor modA  23.25 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4339  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.22 
 
 
258 aa  42  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>