69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3335 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  100 
 
 		 259 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  93.82 
 
 		 259 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  74.69 
 
 		 260 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  72.18 
 
 		 279 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  71.77 
 
 		 279 aa  358  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  72.69 
 
 		 260 aa  358  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  75.3 
 
 		 256 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  68.11 
 
 		 276 aa  353  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  70.08 
 
 		 260 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  74.89 
 
 		 260 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  70.08 
 
 		 260 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  73.59 
 
 		 260 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  68.95 
 
 		 256 aa  350  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  72.61 
 
 		 260 aa  349  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  73.04 
 
 		 260 aa  348  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  63.56 
 
 		 279 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  67.24 
 
 		 260 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  67.24 
 
 		 260 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  67.24 
 
 		 260 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  67.69 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  67.69 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  67.69 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  66.81 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  67.52 
 
 		 259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  57.38 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  52.92 
 
 		 263 aa  251  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.25 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  51.72 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  51.09 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  50.65 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  47.23 
 
 		 278 aa  211  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  46.12 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  45.96 
 
 		 283 aa  208  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  45.67 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  46.26 
 
 		 263 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  37.02 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  37.77 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  38.17 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  38.17 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  37.1 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.85 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  38.3 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.84 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  37.97 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  29.91 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  32.08 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  32.38 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  32.28 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  35.06 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  34.22 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  28.95 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  31.37 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  26.52 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3757  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.02 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0635929 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3667  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.03 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341489  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4504  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.49 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0793086  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3860  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.49 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0644367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3228  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.21 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2236  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  26.17 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607578  normal  0.187927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50670  molybdenum transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.39 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.646558  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0979  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.03 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2342  molybdate ABC transporter, molybdate-binding protein  20 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.237075  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2665  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.06 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0609537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2054  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  20 
 
 		 256 aa  45.8  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1579  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.92 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0813  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.33 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0106  putative molybdate-binding periplasmic signal peptide protein  25.5 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4560  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.13 
 
 		 279 aa  42  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119032  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0571  molybdenum ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  25.59 
 
 		 258 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>