63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5739 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  100 
 
 		 230 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  60.89 
 
 		 236 aa  258  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  62.1 
 
 		 219 aa  251  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  55.26 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  49.33 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  48.89 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  48.44 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  53.71 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  58.26 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  56.05 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  48.88 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  46.4 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  47.57 
 
 		 263 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  45.99 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  41.92 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  44.09 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  45.21 
 
 		 273 aa  141  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  44.92 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  42.47 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  41.62 
 
 		 267 aa  129  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.57 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  44.17 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  38.04 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 279 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  40.11 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  38.95 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  40.12 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  37.63 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  40.32 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  38.37 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  33.94 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  37.79 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  40.32 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  39.78 
 
 		 260 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  39.78 
 
 		 260 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  39.78 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  39.78 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  39.78 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  34.48 
 
 		 259 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  35.06 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  37.1 
 
 		 279 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  38.24 
 
 		 256 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 268 aa  98.6  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  30.59 
 
 		 259 aa  95.1  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  29.91 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  36.23 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2540  hypothetical protein  31.58 
 
 		 183 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.560007 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2054  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  18.48 
 
 		 256 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1334  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.21 
 
 		 281 aa  45.1  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.36729  normal  0.0167209 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1269  molybdate transporter periplasmic protein  22.94 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3065  molybdate transporter periplasmic protein  23.39 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2342  molybdate ABC transporter, molybdate-binding protein  18.01 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.237075  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3481  molybdate-binding periplasmic protein precursor  27.44 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3769  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.79 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1161  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.31 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0188825  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1254  molybdate transporter periplasmic protein  23.61 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.894864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>