67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0340 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  100 
 
 		 236 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  63.96 
 
 		 229 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  58.97 
 
 		 258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  64.84 
 
 		 219 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  60.63 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  58.55 
 
 		 272 aa  271  7e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  63.56 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  60.89 
 
 		 230 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  55.95 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  54.63 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  53.78 
 
 		 235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  49.55 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  45.12 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  44.93 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  44.65 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.54 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  42.33 
 
 		 283 aa  138  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  42.47 
 
 		 278 aa  135  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  36.99 
 
 		 273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  38.38 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  37 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  39.88 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  38.92 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  40.64 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  39.88 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  37.63 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  41.4 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  42.47 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  39.13 
 
 		 274 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 		 268 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  41.94 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  41.94 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  41.94 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  41.94 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  38.73 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  41.94 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  36.7 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  38.71 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  35.27 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  38.27 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  32.43 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  36.22 
 
 		 256 aa  111  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.56 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.08 
 
 		 259 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  31.51 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  29.19 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  28.16 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2540  hypothetical protein  33.09 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.560007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4477  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.68 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.763394 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3481  molybdate-binding periplasmic protein precursor  28.37 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4941  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.24 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2054  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.65 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2342  molybdate ABC transporter, molybdate-binding protein  21.65 
 
 		 256 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.237075  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2331  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.58 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.618234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3883  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  30.39 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  normal  0.216536 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03850  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.43 
 
 		 299 aa  45.4  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.493033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4895  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  32.89 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2560  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  26.32 
 
 		 277 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403904  normal  0.205693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1558  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  25.44 
 
 		 277 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.455674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2665  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.48 
 
 		 246 aa  42  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0609537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1370  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  19.91 
 
 		 262 aa  42  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.215303  normal  0.092476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>