76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3180 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  55.64 
 
 		 259 aa  289  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  58.69 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  57.38 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  58.33 
 
 		 276 aa  278  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  55.73 
 
 		 279 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  55.73 
 
 		 279 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  53.85 
 
 		 260 aa  268  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  60.09 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  55.98 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  60.09 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  60.09 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  60.43 
 
 		 260 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  60.43 
 
 		 260 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  60.43 
 
 		 260 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  52.12 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  55 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  59.66 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  57.39 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  55.47 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  55.56 
 
 		 260 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  55.56 
 
 		 260 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  55.56 
 
 		 260 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  53.33 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  57.08 
 
 		 260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  52.38 
 
 		 263 aa  245  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.59 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  49.15 
 
 		 263 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  50.21 
 
 		 263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  45.61 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  44.96 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  44.86 
 
 		 274 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  42.75 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  45.34 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  44.78 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  33.33 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  37.63 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  37.63 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  37.63 
 
 		 272 aa  125  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  36.61 
 
 		 229 aa  125  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  33.8 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  36.56 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  33.19 
 
 		 233 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.8 
 
 		 235 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.52 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.38 
 
 		 235 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  37.7 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  35.88 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  33.33 
 
 		 230 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  35.1 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  30.94 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  26.52 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0449  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.1 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3543  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.38 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50670  molybdenum transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.68 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.646558  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0979  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1942  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.4 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2665  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.37 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0609537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2941  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  25.3 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3828  molybdenum ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  25.98 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1377  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.69 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3197  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.7 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2973  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.42 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40390  molybdate-binding periplasmic protein precursor modA  24.47 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2756  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  24.79 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0851797  normal  0.0478662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1356  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.05 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2037  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.72 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0340  molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  24.82 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4254  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.12 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.60932  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4169  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.59 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000521037  normal  0.0708961 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3871  ABC molybdate transporter, periplasmic binding protein ModA  22.59 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.609422  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2672  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.19 
 
 		 241 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2342  molybdate ABC transporter, molybdate-binding protein  18.62 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.237075  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2054  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  18.62 
 
 		 256 aa  42  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0328  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.72 
 
 		 260 aa  42  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>