57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3934 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 279 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  64.45 
 
 		 260 aa  326  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  63.39 
 
 		 276 aa  326  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  63.39 
 
 		 259 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  65.52 
 
 		 260 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  65.52 
 
 		 260 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  60.47 
 
 		 279 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  61.33 
 
 		 279 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  65.24 
 
 		 260 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  63.56 
 
 		 259 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  65.09 
 
 		 260 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  65.09 
 
 		 260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  64.66 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  66.23 
 
 		 260 aa  318  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  65.57 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  67.53 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  67.53 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  67.53 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  67.25 
 
 		 260 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  67.25 
 
 		 260 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  67.25 
 
 		 260 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  59.11 
 
 		 256 aa  291  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  66.67 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  61.8 
 
 		 259 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  59.15 
 
 		 263 aa  265  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  52.12 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  53.9 
 
 		 263 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  51.68 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  55.88 
 
 		 263 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  51.52 
 
 		 278 aa  218  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  49.37 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  48.1 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  43.46 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  47.86 
 
 		 274 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  45.3 
 
 		 263 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  38.26 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  38.79 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  32.43 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  31.66 
 
 		 272 aa  142  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  36.51 
 
 		 233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  39.04 
 
 		 235 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  36.7 
 
 		 236 aa  122  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  33.49 
 
 		 219 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  42.02 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  38.83 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  35.48 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  35 
 
 		 226 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  36.8 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  37.1 
 
 		 230 aa  92.4  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  29.49 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  29.44 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.89 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3664  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.91 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3481  molybdate-binding periplasmic protein precursor  26.04 
 
 		 250 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1283  molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4477  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.2 
 
 		 269 aa  42  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.763394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>