101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6135 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
263 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  82.51 
 
 
263 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.65 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  59.76 
 
 
263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  57.51 
 
 
260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  57.51 
 
 
260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  58.72 
 
 
260 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  57.81 
 
 
260 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  59.18 
 
 
279 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  57.08 
 
 
260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  56.17 
 
 
279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  56.6 
 
 
279 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  57.64 
 
 
260 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  59.66 
 
 
278 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  56.65 
 
 
260 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  58.95 
 
 
260 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  56.57 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  57.26 
 
 
283 aa  258  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  57.02 
 
 
263 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  54.08 
 
 
276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  53.09 
 
 
274 aa  244  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  54.04 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  56.22 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  55.79 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  55.79 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  49.8 
 
 
256 aa  241  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  55.79 
 
 
260 aa  241  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  50.63 
 
 
259 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  50.63 
 
 
259 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  55.84 
 
 
260 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  55.84 
 
 
260 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  55.84 
 
 
260 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  46.96 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  49.15 
 
 
268 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  51.06 
 
 
259 aa  222  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  41.13 
 
 
261 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  42.31 
 
 
229 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  41.99 
 
 
258 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  47.85 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  47.31 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  45.12 
 
 
236 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  43.58 
 
 
233 aa  148  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  43.78 
 
 
235 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  46.58 
 
 
230 aa  138  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  43.24 
 
 
219 aa  138  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  39 
 
 
235 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  45.99 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  43.78 
 
 
235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  38.57 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  36.17 
 
 
229 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  31.25 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  36 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  30.6 
 
 
232 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3197  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.29 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1283  molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  31.1 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2941  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  26.19 
 
 
251 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3543  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.87 
 
 
252 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.020365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1942  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2756  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  25.83 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0851797  normal  0.0478662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2973  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.2 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4339  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.62 
 
 
258 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3427  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  27.57 
 
 
251 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50670  molybdenum transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.92 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.646558  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3828  molybdenum ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  26.12 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2540  hypothetical protein  35.77 
 
 
183 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.560007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40390  molybdate-binding periplasmic protein precursor modA  26.56 
 
 
251 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3481  molybdate-binding periplasmic protein precursor  27.56 
 
 
250 aa  53.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1541  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  25.77 
 
 
267 aa  52  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1998  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.69 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.741261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1254  molybdate transporter periplasmic protein  24.51 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.894864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 
335 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0449  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.1 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3757  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.48 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0635929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01300  periplasmic molybdate-binding protein, ModA2  24.69 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2821  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.28 
 
 
261 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2178  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.53 
 
 
268 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000275297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2331  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.92 
 
 
271 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.618234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0970  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  26.17 
 
 
272 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2054  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.83 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2342  molybdate ABC transporter, molybdate-binding protein  21.83 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.237075  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4895  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  36 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3228  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.09 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0441  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.2 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3464  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  33.04 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0244106  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4504  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.9 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0793086  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1556  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  21.83 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3860  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.9 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0644367  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3667  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.9 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341489  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4560  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.6 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119032  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000117  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdenum-binding protein ModA  22.09 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2474  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.65 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3124  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.23 
 
 
251 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1798  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.71 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0108001 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0748  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.86 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0410  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.21 
 
 
296 aa  42.7  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00464746  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5514  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.38 
 
 
265 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3709  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  31.48 
 
 
265 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4477  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.36 
 
 
269 aa  42.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.763394 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2236  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  25.3 
 
 
291 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607578  normal  0.187927 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1579  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.17 
 
 
262 aa  42  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>