81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0980 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  100 
 
 		 229 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  51.54 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  50.22 
 
 		 235 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  50.92 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  47.51 
 
 		 229 aa  211  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  49.55 
 
 		 236 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  47.53 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  48.87 
 
 		 230 aa  184  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  46.4 
 
 		 230 aa  178  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  40.97 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  40.53 
 
 		 272 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  40.53 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  44.3 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  35.62 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  37.43 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.17 
 
 		 264 aa  118  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  38.89 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  39.35 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  39.35 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  39.35 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  39.35 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  39.35 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  39.35 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  32.42 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  34.32 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  35.83 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  37.79 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  37.21 
 
 		 260 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  36.51 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 		 279 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  36.7 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  38.07 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  34.76 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  34.22 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  34.22 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  37.5 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  32.87 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  33.86 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.28 
 
 		 259 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.75 
 
 		 259 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  33.16 
 
 		 256 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  32.26 
 
 		 274 aa  89  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  28.76 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  30.39 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3464  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.5 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0244106  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3319  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.89 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0410  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  30.97 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00464746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0813  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.97 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0748  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.89 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  30 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2342  molybdate ABC transporter, molybdate-binding protein  26.72 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.237075  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2054  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.72 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0970  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  21.56 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3481  molybdate-binding periplasmic protein precursor  26.48 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2665  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.46 
 
 		 246 aa  48.9  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0609537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1453  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.1 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2540  hypothetical protein  27.65 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.560007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1356  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.29 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2198  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.73 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0846533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1207  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.33 
 
 		 265 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1370  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.66 
 
 		 262 aa  45.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.215303  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1556  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  24.32 
 
 		 276 aa  45.1  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3495  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 375 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  0.246878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2471  extracellular solute-binding protein  37.62 
 
 		 390 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1094  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.27 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01600  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.76 
 
 		 310 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.658672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0413  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  28.7 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1708  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  28.44 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.358043 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1443  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.03 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2613  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0328  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.03 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3323  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.61 
 
 		 249 aa  42  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3871  ABC molybdate transporter, periplasmic binding protein ModA  24 
 
 		 258 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.609422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>