69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3166 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  100 
 
 		 259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  93.82 
 
 		 259 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  73.79 
 
 		 279 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  76.76 
 
 		 260 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  70.43 
 
 		 260 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  71.88 
 
 		 279 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  75.29 
 
 		 256 aa  363  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  70.82 
 
 		 260 aa  358  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  71.65 
 
 		 260 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  76.62 
 
 		 260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  71.65 
 
 		 260 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  71.21 
 
 		 260 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  74.78 
 
 		 260 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  71.08 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  67.34 
 
 		 256 aa  345  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  63.39 
 
 		 279 aa  325  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  68.1 
 
 		 260 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  68.1 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  68.1 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  68.56 
 
 		 260 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  68.56 
 
 		 260 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  68.56 
 
 		 260 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  67.67 
 
 		 260 aa  308  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  67.52 
 
 		 259 aa  305  6e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  55.64 
 
 		 268 aa  289  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  52.34 
 
 		 263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.18 
 
 		 264 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  51.09 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  51.29 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  51.52 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  47.66 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  46.46 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  46.38 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  47.08 
 
 		 274 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  45.37 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  37.02 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  38.3 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  38.3 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  38.3 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  34.33 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.96 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  38.02 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  37.43 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.83 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  30.09 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  32.56 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  32.86 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  31.75 
 
 		 229 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  34.48 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  32 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  28.42 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  30.26 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  26.84 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3667  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.94 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341489  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3757  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.71 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0635929 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3860  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.94 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0644367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4504  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.94 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0793086  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3228  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.71 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2236  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  26.09 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607578  normal  0.187927 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4885  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.3 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207851 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2665  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.6 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0609537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1579  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.11 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3197  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.1 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0979  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.51 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50670  molybdenum transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.52 
 
 		 252 aa  45.8  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.646558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2342  molybdate ABC transporter, molybdate-binding protein  20.8 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.237075  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2054  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  20.8 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2848  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  23.46 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4560  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.19 
 
 		 279 aa  42  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>